Claudio Pizarro slog igenom i Werder Bremen och köptes sedan av Bayern München. Därefter har han flyttat mellan klubbarna ett par gånger, men nu spelar han i Werder Bremen där han slog igenom. Pizarro har tidigare spelat i den engelska storklubben Chelsea, men där fick han snålt med speltid och gjorde endast 2 mål på 21 matcher vilket resulterade i en övergång tillbaks till Tyskland.
Den 23 oktober 2010 i ett Bundesliga-möte mellan Borussia Mönchengladbach och Werden Bremen (1-4) gjorde han sitt 134 mål i Bundesliga och gick därmed om Giovane Élber i skyttelistan "flest mål av en utländsk spelare". I Werder Bremen har han hittills gjort 176 mål (2015). Med sina 383 Bundesligamatcher (2015) toppar han även listan med flesta matcher av en utländsk spelare.
Claudio Pizarros smeknamn inom fotbollen är The Bomber och även "Inca God". När Pizarro blev värvad av den tyska klubben Werder Bremen och gjorde succé där blev han även en toppspelare i A-Landslaget.