William James Stewart Lockyer, född 12 januari 1868, död 15 juli 1936[2], var en brittisk astronom. Han var son till Norman Lockyer.
Lockyer blev 1898 assistent vid Solar physics observatory i South Kensington och 1920 chef för det av fadern grundade Norman Lockyer-observatoriet i Sidmouth, där han ägnade sig åt spektografiska undersökningar av solen och stjärnorna.