Lista över covid-19-simuleringsmodeller

Från Wikipedia

Covid-19-simuleringsmodeller är matematiska modeller av smitsamma sjukdomar för spridning av covid-19.[1] Listan bör inte förväxlas med COVID-19-appar som huvudsakligen används för smittspårning av sociala kontakter.

Observera att några av de listade applikationerna är modeller eller simulatorer som endast är webbplatser, och vissa av dem är beroende av (eller använder) realtidsdata från andra källor.

Modeller med mest vetenskapliga stöd[redigera | redigera wikitext]

Underlistan innehåller simulatorer som bygger på teoretiska modeller. På grund av det höga antalet förtryckta undersökningar som skapats och drivits av Covid-19-pandemin,[2] bör särskilt nyare modeller endast övervägas med ytterligare vetenskaplig stränghet.[3][4][5]

Simuleringar och modeller[redigera | redigera wikitext]

  • Chen et al. simulering baserad på BHRP-modellen ( Bats-Hosts-Reservoir-People) (endast förenklad till RP)[6]
  • CoSim19[7] - Prof Lehr, baserat på SEIRD-modellen
  • COVID-19 MOBILITY MODELLING[8] - Stanford baserat på SEIR-modell[9]
  • COVID-19 Simulator[10] - Harvard Medical School baserad på en validerad systemdynamikmodell[11]
  • COVID-19 Surge[12] - CDC[12]
  • COVIDSIM[13] - av Mark Kok Yew Ng et al.
  • CovidSim - Imperial College London , MRC Center for Global Infectious Disease Analysis , Neil Ferguson et al.
  • CovidSim[14]  - Forskningsprojekt vid University of Applied Sciences i München, Prof Köster
  • COVIDSim[15]  - skriven i MATLAB[15] av Ng och Gui[16]
  • CovidSIM.eu[17]  - Martin Eichner, Markus Schwehm med stöd av universitetet i Tübingen och sponsrat av det tyska federala utbildningsministeriet.[17]
  • CovidSIM[18] - Schneider et al.
  • CovRadar[19]  - för molekylär övervakning av Corona-spikproteinet[20]
  • Dr. Ghaffarzadegans modell[21][22]
  • Event Horizon[23] - COVID-19  - HU Berlin baserat på SIR-X-modell[24]
  • Evolutionär AI[25]  - "Icke-läkemedelsinterventioner (NPI) som AI genererar för olika länder och regioner över tiden, deras förutsagda effekt."[25][26][27]
  • IHME-modell - COVID-modell för institut för hälsovetenskap och utvärdering
  • OxCGRT[28]  - Oxford COVID-19 Government Response Tracker[27][28]
  • SC-COSMO[29]  - Stanford-CIDE Coronavirus Simulation Model
  • Smart investering av virus-RNA-testresurser för att förbättra Covid-19-begränsning[30][31]
  • SIAMs Epidemiology Collection[32]
  • Youyang Gu COVID-modell

Genomdatabaser[redigera | redigera wikitext]

Flera av dessa modeller använder sig av genomdatabaser, inklusive följande:

Konsortier, forskningskluster och andra samlingar[redigera | redigera wikitext]

  • CDC-lista över prognoser inkludering och antaganden[33] - stor lista med olika modeller, etc.
  • COVID-19 Forecast Hub[34] - Fungerar som ett centralt arkiv med prognoser och förutsägelser från över 50 internationella forskargrupper.[35][34]
  • Nextstrain - Öppet källkodsprojekt för att utnyttja den vetenskapliga och folkhälsopotentialen hos patogen genomdata[36]
    • Se även Nextstrains SARS-CoV-2-resurser[37]
  • SIMID[38] - Simuleringsmodeller av infektionssjukdomar - Belgiens forskningskonsortium
  • RAMP - Snabbt stöd vid modellering av pandemin[39] (Storbritannien)
  • UT Austin COVID-19 modelleringskonsortium[40]

Vaccinationspanel, modeller eller instrumentpaneler[redigera | redigera wikitext]

  • COVID-19 Dashboard[41] - Center for Systems Science and Engineering (CSSE) vid Johns Hopkins University (JHU)[41][42]
  • Datahub Novel Coronavirus 2019 dataset[43][44] - COVID-19 dataset Coronavirus sjukdom 2019 (COVID-19) tidsserier som visar bekräftade fall, rapporterade dödsfall och rapporterade återhämtningar.
  • Simulation der COVID19-Impfkampagne[45] - Monitor för vaccinationskampanj i Tyskland av Zi Data Science Lab
  • Institutet för hälsametriker och utvärdering (IHME) COVID-19-prognoser[46]

Modeller med mindre vetenskapligt stöd[redigera | redigera wikitext]

Följande modeller är endast för utbildningsändamål.

  • Covid-19 Simulator[47]
  • COVID19: Topp 7 - En kurerad lista[48] publicerad på Medium[48]
  • github.com/topics: covid-19[49]
  • ISEE Systems COVID-19-simulator[50]
  • nCoV2019.live[51]  - av Schiffmann / Conlon
    • cov19.cc- av Conlon[52]
  • Simul8 - COVID-19 simuleringsresurser[53]
  • Simulera coronavirus med SIR-modellen[54]
  • Virusspridningssimulering[55]

Se även[redigera | redigera wikitext]

Referenser[redigera | redigera wikitext]

  1. ^ Adam, David (2020-04-02). ”Special report: The simulations driving the world’s response to COVID-19” (på engelska). Nature 580 (7803): sid. 316–318. doi:10.1038/d41586-020-01003-6. https://www.nature.com/articles/d41586-020-01003-6. Läst 6 juni 2021. 
  2. ^ ”The role of research preprints in the academic response to the COVID-19 epidemic - Authorea”. www.authorea.com. https://www.authorea.com/users/305982/articles/436710-the-role-of-research-preprints-in-the-academic-response-to-the-covid-19-epidemic?commit=bbd7a90d14b09c2d509b6abfb0fbf2a9882ef43b. Läst 6 juni 2021. 
  3. ^ ”Another 178,000 deaths? Scientists' latest virus projection is a warning” (på engelska). NBC News. https://www.nbcnews.com/science/science-news/vindicated-covid-19-models-warn-pandemic-far-over-n1240934. Läst 6 juni 2021. 
  4. ^ Tufekci, Zeynep (2 april 2020). ”Don’t Believe the COVID-19 Models” (på engelska). The Atlantic. https://www.theatlantic.com/technology/archive/2020/04/coronavirus-models-arent-supposed-be-right/609271/. Läst 6 juni 2021. 
  5. ^ Gonçalves, Bruno (9 september 2020). ”Epidemic Modeling 102: All CoVID-19 models are wrong, but some are useful” (på engelska). Medium. https://medium.data4sci.com/epidemic-modeling-102-all-covid-19-models-are-wrong-but-some-are-useful-c81202cc6ee9. Läst 6 juni 2021. 
  6. ^ Chen, Tian-Mu; Rui, Jia; Wang, Qiu-Peng; Zhao, Ze-Yu; Cui, Jing-An; Yin, Ling (2020-02-28). ”A mathematical model for simulating the phase-based transmissibility of a novel coronavirus”. Infectious Diseases of Poverty 9. doi:10.1186/s40249-020-00640-3. ISSN 2095-5162. PMID 32111262. PMC: 7047374. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7047374/. Läst 6 juni 2021. 
  7. ^ ”CoSim Online”. shiny.covid-simulator.com. https://shiny.covid-simulator.com/covidsim/. Läst 6 juni 2021. 
  8. ^ ”COVID-19 MOBILITY NETWORK MODELING”. covid-mobility.stanford.edu. https://covid-mobility.stanford.edu/. Läst 7 juni 2021. 
  9. ^ Chang, Serina; Pierson, Emma; Koh, Pang Wei; Gerardin, Jaline; Redbird, Beth; Grusky, David (2021-01). ”Mobility network models of COVID-19 explain inequities and inform reopening” (på engelska). Nature 589 (7840): sid. 82–87. doi:10.1038/s41586-020-2923-3. ISSN 1476-4687. https://www.nature.com/articles/s41586-020-2923-3. Läst 6 juni 2021. 
  10. ^ ”Home - COVID-19 Simulator”. covid19sim.org. https://covid19sim.org/. Läst 6 juni 2021. 
  11. ^ User, Super. ”Policy Simulator Methodology” (på brittisk engelska). COVID-19 Simulator. https://covid19sim.org/documents/policy-methods. Läst 6 juni 2021. 
  12. ^ [a b] CDC (11 februari 2020). ”Healthcare Workers” (på amerikansk engelska). Centers for Disease Control and Prevention. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/hcp/COVIDSurge.html. Läst 6 juni 2021. 
  13. ^ Ng, Mark Kok Yew. ”SEIRS-based COVID-19 Simulation Package” (på engelska). markusng.com. https://www.markusng.com/COVIDSIM/. Läst 6 juni 2021. 
  14. ^ ”Munich University MUAS - Research project - CovidSim - Modeling and simulation of covid infection spread in crowds in system relevant infrastructures”. www.hm.edu. https://www.hm.edu/en/research/projects/project_details/koester_1/covidsim.en.html. Läst 6 juni 2021. 
  15. ^ [a b] ”nkymark/COVIDSim”. 23 december 2020. https://github.com/nkymark/COVIDSim. Läst 6 juni 2021. 
  16. ^ Ng, Kok Yew; Gui, Meei Mei (2020-10). ”COVID-19: Development of a robust mathematical model and simulation package with consideration for ageing population and time delay for control action and resusceptibility”. Physica D. Nonlinear Phenomena 411: sid. 132599. doi:10.1016/j.physd.2020.132599. ISSN 0167-2789. PMID 32536738. PMC: 7282799. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7282799/. Läst 6 juni 2021. 
  17. ^ [a b] ”CovidSIM”. covidsim.eu. http://covidsim.eu/. Läst 6 juni 2021. 
  18. ^ Schneider, Kristan A.; Ngwa, Gideon A.; Schwehm, Markus; Eichner, Linda; Eichner, Martin (2020-11-19). ”The COVID-19 pandemic preparedness simulation tool: CovidSIM”. BMC Infectious Diseases 20. doi:10.1186/s12879-020-05566-7. ISSN 1471-2334. PMID 33213360. PMC: 7675392. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7675392/. Läst 6 juni 2021. 
  19. ^ ”CovRadar”. covradar.net. https://covradar.net/. Läst 6 juni 2021. 
  20. ^ ”Molecular surveillance of SARS-CoV-2 spike protein mutations using CovRadar” (på engelska). News-Medical.net. 7 februari 2021. https://www.news-medical.net/news/20210207/Molecular-surveillance-of-SARS-CoV-2-spike-protein-mutations-using-CovRadar.aspx. Läst 6 juni 2021. 
  21. ^ ”COVID-19 in Universities”. forio.com. https://forio.com/app/navidg/covid-19-v2/index.html#dashboard~cmbo.html. Läst 6 juni 2021. 
  22. ^ Ghaffarzadegan, Navid (2021-02-01). ”Simulation-based what-if analysis for controlling the spread of Covid-19 in universities”. PLoS ONE 16 (2). doi:10.1371/journal.pone.0246323. ISSN 1932-6203. PMID 33524045. PMC: 7850497. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7850497/. Läst 6 juni 2021. 
  23. ^ ”Event Horizon - COVID-19” (på engelska). rocs.hu-berlin.de. http://rocs.hu-berlin.de/corona/. Läst 6 juni 2021. 
  24. ^ Maier, Benjamin F.; Brockmann, Dirk (2020-05-15). ”Effective containment explains subexponential growth in recent confirmed COVID-19 cases in China”. Science (New York, N.y.) 368 (6492): sid. 742–746. doi:10.1126/science.abb4557. ISSN 0036-8075. PMID 32269067. PMC: 7164388. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7164388/. Läst 6 juni 2021. 
  25. ^ [a b] ”Evolutionary AI”. evolution.ml. https://evolution.ml/. Läst 6 juni 2021. 
  26. ^ Miikkulainen, Risto; Francon, Olivier; Meyerson, Elliot; Qiu, Xin; Canzani, Elisa; Hodjat, Babak (2020-08-01). ”From Prediction to Prescription: Evolutionary Optimization of Non-Pharmaceutical Interventions in the COVID-19 Pandemic”. arXiv:2005.13766 [cs]. http://arxiv.org/abs/2005.13766. Läst 6 juni 2021. 
  27. ^ [a b] ”Full Page Reload” (på engelska). IEEE Spectrum: Technology, Engineering, and Science News. https://spectrum.ieee.org/the-human-os/artificial-intelligence/medical-ai/can-computer-models-select-the-best-public-health-interventions-for-covid19. Läst 6 juni 2021. 
  28. ^ [a b] ”COVID-19 Government Response Tracker” (på engelska). www.bsg.ox.ac.uk. https://www.bsg.ox.ac.uk/research/research-projects/covid-19-government-response-tracker. Läst 6 juni 2021. 
  29. ^ ”sc-cosmo – Stanford-CIDE COronavirus Simulation MOdel” (på amerikansk engelska). https://www.sc-cosmo.org/. Läst 6 juni 2021. 
  30. ^ ”COVID-19 Simulation Tool”. corona-lab.ch. https://corona-lab.ch/. Läst 6 juni 2021. 
  31. ^ Gorji, Hossein; Arnoldini, Markus; Jenny, David F.; Hardt, Wolf-Dietrich; Jenny, Patrick (2020-12-02). ”Smart Investment of Virus RNA Testing Resources to Enhance Covid-19 Mitigation” (på engelska). medRxiv: sid. 2020.11.30.20239566. doi:10.1101/2020.11.30.20239566. https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.11.30.20239566v1. Läst 6 juni 2021. 
  32. ^ ”SIAM EpidemiologyCollection (Society for Industrial and Applied Mathematics)” (på amerikansk engelska). epubs.siam.org. https://epubs.siam.org/page/EpidemiologyCollection. Läst 6 juni 2021. 
  33. ^ CDC (11 februari 2020). ”Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)” (på amerikansk engelska). Centers for Disease Control and Prevention. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/science/forecasting/forecasts-cases.html. Läst 6 juni 2021. 
  34. ^ [a b] ”Home - COVID 19 forecast hub”. covid19forecasthub.org. https://covid19forecasthub.org/. Läst 6 juni 2021. 
  35. ^ Boice, Ryan Best, Jay (1 maj 2020). ”Where The Latest COVID-19 Models Think We're Headed — And Why They Disagree” (på engelska). FiveThirtyEight. https://projects.fivethirtyeight.com/covid-forecasts/. Läst 6 juni 2021. 
  36. ^ ”Nextstrain” (på engelska). nextstrain.org. https://nextstrain.org/. Läst 6 juni 2021. 
  37. ^ ”Nextstrain” (på engelska). nextstrain.org. https://nextstrain.org/sars-cov-2/. Läst 6 juni 2021. 
  38. ^ ”SIMID – Simulation Models of Infectious Diseases” (på engelska). https://www.simid.be/. Läst 6 juni 2021. 
  39. ^ ”Rapid Assistance in Modelling the Pandemic: RAMP | Royal Society” (på brittisk engelska). royalsociety.org. https://royalsociety.org/topics-policy/Health%20and%20wellbeing/ramp/. Läst 6 juni 2021. 
  40. ^ ”UT COVID-19 Modeling Consortium”. covid-19.tacc.utexas.edu. https://covid-19.tacc.utexas.edu/. Läst 6 juni 2021. 
  41. ^ [a b] ”COVID-19 Map” (på engelska). Johns Hopkins Coronavirus Resource Center. https://coronavirus.jhu.edu/map.html. Läst 6 juni 2021. 
  42. ^ Dong, Ensheng; Du, Hongru; Gardner, Lauren (2020-05-01). ”An interactive web-based dashboard to track COVID-19 in real time” (på english). The Lancet Infectious Diseases 20 (5): sid. 533–534. doi:10.1016/S1473-3099(20)30120-1. ISSN 1473-3099. PMID 32087114. https://www.thelancet.com/journals/laninf/article/PIIS1473-3099(20)30120-1/abstract. Läst 6 juni 2021. 
  43. ^ Datopian. ”Novel Coronavirus 2019” (på engelska). DataHub. https://datahub.io/core/covid-19. Läst 6 juni 2021. 
  44. ^ ”datasets/covid-19”. Data Packaged Core Datasets. 6 juni 2021. https://github.com/datasets/covid-19. Läst 6 juni 2021. 
  45. ^ ”Simulation der COVID19-Impfkampagne” (på tyska). www.zidatasciencelab.de. https://www.zidatasciencelab.de/cov19vaccsim/. Läst 6 juni 2021. 
  46. ^ ”IHME | COVID-19 Projections” (på engelska). Institute for Health Metrics and Evaluation. https://covid19.healthdata.org/. Läst 6 juni 2021. 
  47. ^ ”Covid-19 simulator”. www.coronasimulator.com. https://www.coronasimulator.com/. Läst 6 juni 2021. 
  48. ^ [a b] Prabowo, Arian (3 maj 2020). ”COVID19: Top 7 online interactive simulations, curated.” (på engelska). Medium. https://towardsdatascience.com/covid19-top-7-online-interactive-simulations-curated-fa4282889875. Läst 6 juni 2021. 
  49. ^ ”Build software better, together” (på engelska). GitHub. https://github.com/. Läst 6 juni 2021. 
  50. ^ ”COVID-19 Simulator”. exchange.iseesystems.com. https://exchange.iseesystems.com/public/isee/covid-19-simulator/index.html. Läst 6 juni 2021. 
  51. ^ ”Coronavirus Dashboard” (på engelska). ncov2019.live. https://ncov2019.live/. Läst 6 juni 2021. 
  52. ^ ”Coronavirus Tracker”. cov19.cc. https://cov19.cc/. Läst 6 juni 2021. 
  53. ^ ”COVID-19 Simulation Resources”. https://www.simul8.com/covid-19-simulation-resources. Läst 7 juni 2021. 
  54. ^ ”Simulating coronavirus with the SIR model”. fatiherikli.github.io. Arkiverad från originalet den 19 april 2021. https://web.archive.org/web/20210419152720/https://fatiherikli.github.io/coronavirus-simulation/. Läst 6 juni 2021. 
  55. ^ ”Covid-19 Spread Simulation”. c19model.com. https://c19model.com/. Läst 6 juni 2021. 
Hämtad från ”https://sv.wikipedia.org/w/index.php?title=Lista_över_covid-19-simuleringsmodeller&oldid=54071388”