Paleogenomik: Skillnad mellan sidversioner
v1 |
(Ingen skillnad)
|
Versionen från 13 mars 2023 kl. 23.14
Paleogenomik är en vetenskapsgren baserad på rekonstruktionen av genomiskt material hos utdöda arter. Forskningsfältet har vuxit fram utifrån förbättrade metoder att utvinna forntida DNA från artefakter på museer, iskärnor, arkeologiska eller palenteologiska utgrävningar och DNA-sekvensering. Det är numera möjligt att upptäckta genetisk drift, folkvandringar och släktskap i äldre tid, utvecklingshistorien hos utdöda växt- och djurarter, liksom identifikation av fenotypiska drag i olika geografiska regioner. Forskare kan också använda paleogenomik till att jämföra forntida anfäder med moderna människor.[1] Paleogenomikens växande betydelse märks bland annat genom att 2022 års Nobelprisi fysiologi eller medicin tilldelades den svenske genetikern Svant Pääbo, med betydande insatser inom paleogenomik bakom sig.
Bakgrund
Ursprungligen inkluderar äldre DNA-sekvensering klonandet av små fragment till bakterier, vilket gav en låg träffsäkerhet genom den mångtusenåriga förstöringen av det genetiska materialet genom oxidering.[2] Forntida DNA är svårt att analysera på grund av nedbrytandet i nukleaser. Protokoll för utvinnandet och kontamineringen var nödvändiga för tillförlitliga analyser. [3]
Med utvecklandet av polymeraskedjereaktionen 1983 kunde forskare studera upp till cirka 100 000 år gamla DNA-prov; detta var en begränsning hos de relativt korta isolerade fragmenten. Genom framsteg i isolerandet, förstärkningen, sekvenseringen och datarekonstruktionen har allt äldre DNA-prov blivit möjliga att analysera. Sedan 1990-talet har mitokondrie-DNA med många kopieringssteg kunnat ge svar på ett antal frågor. Utvecklandet av nya sekvenseringstekniker har gett ytterligare möjligheter. Den här teknologiska revolutionen har gjort det möjligt att utveckla paleogenetiken till en nya vetenskapsgrenen paleogenomik.[1]
Se även
Referenser
- Den här artikeln är helt eller delvis baserad på material från engelskspråkiga Wikipedia, 5 mars 2023.
Noter
- ^ [a b] Lan T. and Lindqvist C. 2018. Paleogenomics: Genome-Scale Analysis of Ancient DNA and Population and Evolutionary Genomic Inferences. In: Population Genomics, Springer, Cham. pp 1-38.
- ^ Pääbo, S. (1 mars 1989). ”Ancient DNA: extraction, characterization, molecular cloning, and enzymatic amplification” (på engelska). ""86"". s. 1939–1943. doi:. ISSN 1091-6490. PMID 2928314.
- ^ Lalueza-Fox, Carles; Castresana, Jose; Bertranpetit, Jaume; Alcover, Josep Antoni; Bover, Pere; Gigli, Elena; Ramírez, Oscar (22 maj 2009). ”Paleogenomics in a Temperate Environment: Shotgun Sequencing from an Extinct Mediterranean Caprine” (på engelska). ""4"". s. e5670. doi:. ISSN 1932-6203. PMID 19461892.