In the Beginning är det första samlingsalbumet med amerikanskatechnical death metal-bandet Nile, som gavs ut 28 november 1999. Albumet innehåller de två EP-albumen Festivals of Atonement (1995) och Ramses Bringer of War
(1997). LP versionen av albumet är begränsad till 1000 kopior. Låtarna "Immortality Through Art" och "Godless" är separat listade på insidan av bookleten.