Banjo-Kazooie-serien är den datorspelserie som inkluderar Banjo och Kazooie som huvudpersoner. Banjo-Kazooie-serien är utvecklad av Rare och Banjo gjorde sin debut år 1997 till Nintendo 64. Ett år senare parades han ihop med Kazooie i spelet Banjo-Kazooie.
Kazooie är medhjälparen till Banjo. Hon är en röd fågel som oftast befinner sig i Banjos ryggsäck. Hennes karaktär är den direkt motsatta Banjos; hon är temperamentsfull, högljudd och otrevlig mot andra. Hon är särskilt otrevlig mot den hjälpsamme mullvaden Bottles. Kazooie är döpt efter musikinstrumentet kazoo.
Tooty är Banjos yngre syster. Hon är en björn med blont hår och är god vän med Bottles. Hon kidnappas i början av Banjo-Kazooie av Gruntilda och spelet handlar om att rädda henne. Hon anses vara väldigt vacker. Det är på grund av det som häxan Gruntilda kidnappar henne, för att stjäla hennes skönhet.
Bottles är en hjälpsam mullvad. Han finns med i större delen av spelet (oftast gömd under marken), men han dyker upp när man stöter på en mullvadshög. Han lär Banjo och Kazooie nya attacker och rörelsemönster, som de sedan kan använda i spelet. Han är god vän med Tooty, men bråkar en del med Kazooie.
Mumbo Jumbo är en schaman som förvandlar Banjo och Kazooie till olika saker genom spelets gång. Mumbo Jumbo accepterar endast Mumboskallar som betalning och kan förvandla våra hjältar till bland annat en myra, en valross, en krokodil eller en pumpa.
Gruntilda Winkybunion, även kallad Grunty, är skurken och en häxa som kidnappar lilla Tooty för att stjäla hennes skönhet, men Banjo och Kazooie lyckas rädda henne och begraver Grunty under en sten.
Brentilda, en av Gruntildas systrar; hon talar om för Banjo och Kazooie olika hemligheter som kan vara till hjälp senare i spelet. Hon förekommer både i Banjo-Kazooie och Banjo-Tooie.