Kansas blev 1861 USA:s 34:e delstat och till de två första senatorerna valdes Pomeroy samt James H. Lane.[1] Efter två mandatperioder i senaten ställde Pomeroy upp för omval i senatsvalet 1873. Han blev anklagad för att ha mutat en ledamot av Kansas lagstiftande församling i syfte att säkerställa sitt omval. Republikanerna i Kansas nominerade John James Ingalls i stället för Pomeroy som bedyrade att hela skandalen var en komplott med avsikt att förhindra hans återval. Pomeroy efterträddes av Ingalls i mars 1873. Senatens specialutskott undersökte skandalen men Pomeroy fick inget åtal i fallet. Senator Allen G. Thurman var av annan åsikt men lät bli att föra saken vidare.