Johan Peringskiöld har under sina resor genom sina teckningar gett oss en dyrbar skatt beträffande Skara stifts kyrkor med medeltida anor. Böja 1200-tals kyrka utgör inget undantag. Ursprungligen bestod Böja kyrka av ett mindre rektangulärt långhus med ett kor med rakslutande korvägg i öster. Ett vapenhus byggt av liggtimmer har troligen tillkommit senare. Kyrkan saknade torn. Klockorna hade sin plats i en fristående med bräder inklädd klockstapel. belägen sydväst om kyrkan. Längre fram i tiden förmodligen under slutet av 1600-talet uppfördes ett torn med en hjälmformad huv och en mindre flersidig lanternin.
DopfuntDopfunt av sandsten. Anses utförd av Johannesgruppen och daterad till mitten av 1100-talet.
Altaruppsats med centralmotivet "Kristus på korset" med två gestalter på vardera sida är snidad 1706 av bildhuggaren Jonas i Låstad.
Predikstolen som tillkom 1698 anses utförd av samme bildhuggare som tillverkat altaruppsatsen. Den färgrika korgen i barock är prydd med bilder av Kristus och evangelisterna.
Träskulpturer på södra väggen från ett tidigare altarskåp.