Visa källa för Varianter av sars-cov-2

{{Coronavirus stående}}

'''Varianter av sars-cov-2''' är genetiska varianter av viruset [[sars-cov-2]] som orsakar sjukdomen [[covid-19]]. De flesta ändringar som spelat större roll har varit av typen [[missense-mutation]]er, som leder till att en [[aminosyra]] byts ut mot en annan.

Vissa varianter är eller tros vara [[varianter av särskild betydelse|av särskild betydelse]] på grund av deras ökad smittsamhet,<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Mutation Signatures and In Silico Docking of Novel SARS-CoV-2 Variants of my Concern|förnamn=Nariman|förnamn4=Gary P.|efternamn3=Wong|förnamn3=Gary|efternamn2=Babuadze|förnamn2=George (Giorgi)|efternamn=Shahhosseini|språk=en|url=https://www.mdpi.com/2076-2607/9/5/926|doi=10.3390/microorganisms9050926|nummer=5|volym=9|sid=926|hämtdatum=2021-05-22|år=2021/5|tidskrift=Microorganisms|efternamn4=Kobinger}}</ref> ökad virulens eller minskad effektivitet av vaccin.<ref>{{Tidningsref|rubrik=Coronavirus variants and mutations: The science explained|url=https://www.bbc.com/news/science-environment-55404988|tidning=BBC News|datum=2021-01-06|hämtdatum=2021-05-22|språk=en-GB}}</ref><ref>{{Webbref|titel=New coronavirus variants could cause more reinfections, require updated vaccines|url=https://www.sciencemag.org/news/2021/01/new-coronavirus-variants-could-cause-more-reinfections-require-updated-vaccines|verk=Science {{!}} AAAS|datum=2021-01-15|hämtdatum=2021-05-22|språk=en|förnamn=Kai|efternamn=KupferschmidtJan. 15|efternamn2=2021|förnamn3=4:55|efternamn3=Pm}}</ref>  

Den 31 maj 2021 offentliggjorde [[Världshälsoorganisationen]] ett nytt system för namngivning av varianter, baserat på det grekiska alfabetet. Syftet var att förenkla kommunikation till allmänheten och undvika stigmatiserande namn utifrån var varianter först upptäcktes.<ref>{{Webbref|titel=WHO announces simple, easy-to-say labels for SARS-CoV-2 Variants of Interest and Concern|url=https://www.who.int/news/item/31-05-2021-who-announces-simple-easy-to-say-labels-for-sars-cov-2-variants-of-interest-and-concern|verk=www.who.int|hämtdatum=2021-06-06|språk=en}}</ref>

== Sammanfattning ==
De första tillgängliga virala SARS-CoV-2-genomen samlades in från patienter i december 2019, och kinesiska forskare jämförde dessa tidiga genom med fladdermus- och pangolin-coronavirus-stammar för att uppskatta den ursprungliga coronavirus-typen; den identifierade släktgenomtypen benämndes som "S", och dess dominerande härledda typ benämndes som "L" för att återspegla de muterade förändringarna i [[Proteinstruktur|aminosyran]]. Västerländska forskare genomförde oberoende analyser men benämnde ursprungsvarianten som "A" och den härledda typen som "B". B-typen muterades till ytterligare typer inklusive B.1, som är ursprungstypen till de globala varianterna av särskild betydelse, märkt 2021 av WHO som [[Sars-cov-2 alfa|alfa]]-, [[Sars-cov-2 beta|beta]]-, [[Sars-cov-2 gamma|gamma]]-, [[Sars-cov-2 delta|delta]]- och [[Sars-cov-2 omikron|omikron]]-varianterna.

Följande tabell visar information och risknivå för varianter av särskild betydelse och av särskilt intresse.<ref>{{Webbref|titel=Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/variants/variant-info.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-05-27|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref><ref>{{Webbref|titel=Variants: distribution of cases data|url=https://www.gov.uk/government/publications/covid-19-variants-genomically-confirmed-case-numbers/variants-distribution-of-cases-data|verk=GOV.UK|hämtdatum=2021-05-27|språk=en}}</ref><ref>{{Webbref|titel=PANGO lineages|url=https://cov-lineages.org/global_report.html|verk=cov-lineages.org|hämtdatum=2021-05-27}}</ref><ref>{{Webbref|titel=Living Evidence - SARS-CoV-2 variants|url=https://aci.health.nsw.gov.au/covid-19/critical-intelligence-unit/sars-cov-2-variants|verk=Agency for Clinical Innovation|datum=2021-05-25|hämtdatum=2021-05-27|språk=en|förnamn=Agency for Clinical|efternamn=Innovation|arkivurl=https://web.archive.org/web/20210416012757/https://aci.health.nsw.gov.au/covid-19/critical-intelligence-unit/sars-cov-2-variants|arkivdatum=2021-04-16}}</ref><ref name=":1" /> Intervallen antar en 95% konfidens- eller trovärdighetsnivå om inget annat anges.

Relativ [[Riskmatris|risk]] nivå: {{Legend inline|#faa|Väldigt hög}} {{Legend inline|#fc8|Hög}} {{Legend inline|#fe8|Mellan}} {{Legend inline|#cfc|Låg}} {{Legend inline|#eee|Okänd}} {{Legend inline|#DDFFFF|Eliminerad}}
{| class="wikitable"
|+
! colspan="3" |Identifikation
! colspan="4" |Uppkomst
! colspan="4" |Kliniska förändringar i förhållande till den variant som först identifierades i Wuhan
! colspan="2" |Neutraliserande antikroppsaktivitet (eller effekt när tillgänglig)
|-
![[Världshälsoorganisationen|WHO]] benämning<ref name=":1">{{Webbref|titel=Tracking SARS-CoV-2 variants|url=https://www.who.int/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants|verk=www.who.int|hämtdatum=2021-06-06|språk=en}}</ref>
![[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|PANGOLIN]] variant<ref name=":5">{{Webbref|titel=PANGO lineages|url=https://cov-lineages.org/lineages.html|verk=cov-lineages.org|hämtdatum=2021-03-21}}</ref>
![[Nextstrain]] [[klad]]<ref name=":17">{{Webbref|titel=Nextstrain|url=https://nextstrain.org/|verk=nextstrain.org|hämtdatum=2021-03-21|språk=en}}</ref><ref name="cdc">{{Webbref|titel=Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/variants/variant-info.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-06-06|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref>
!Första [[Sjukdomsutbrott|utbrott]]
!Tidigaste [[Laboratoriediagnos av virusinfektion|prov]]
!Förklarad som en [[variant av särskild betydelse]]
!Cirkulation just nu?{{När/sub|datum=2024-04}}
!Särskilda mutationer
![[Smitta|Smittsamhet]]
![[Heldygnsvård|Sjukhusvistelse]]
![[Mortalitet|Dödlighet]]
!Efter naturlig infektion (risk för återinfektion)
!Från vaccination
|-
|[[Sars-cov-2 delta|Delta]]
|B.1.617.2
|21A
|[[Indien]]
|okt 2020
|6 maj 2021<ref>{{Webbref|url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/984274/Variants_of_Concern_VOC_Technical_Briefing_10_England.pdf|titel=SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England - Technical briefing 10|hämtdatum=6 juni 2021|datum=7 maj 2021|utgivare=Public Health England}}</ref>
| style="background:#ccffcc" |Nej
|L452R, T478K, P681R<ref name="cdc"/>
| style="background:#ffaaaa" | +97% {{Abbr|(76–117%)|95% säkerhetsintervall}}<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Increased transmissibility and global spread of SARS-CoV-2 variants of concern as at June 2021|efternamn=Campbell|förnamn6=Neale|efternamn5=Konings|förnamn5=Franck|efternamn4=Jinnai|förnamn4=Yuka|efternamn3=Laurenson-Schafer|förnamn3=Henry|efternamn2=Archer|förnamn2=Brett|förnamn=Finlay|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8212592/|pmid=34142653|pmc=8212592|doi=10.2807/1560-7917.ES.2021.26.24.2100509|nummer=24|volym=26|sid=2100509|issn=1025-496X|hämtdatum=2021-11-27|år=2021-06-17|tidskrift=Eurosurveillance|efternamn6=Batra}}</ref> 
| style="background:#ffaaaa" | +85% {{Abbr|(39–147%)|95% säkerhetsintervall}} relativt till Alfavarianten<ref>{{Webbref|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8201647/|titel=SARS-CoV-2 Delta VOC in Scotland: demographics, risk of hospital admission, and vaccine effectiveness|hämtdatum=2024-04-26|datum=2021-06-14|utgivare=Lancet}}</ref>
| style="background:#ffaaaa" | ''+137% {{Abbr|(50–230%)|95% säkerhetsintervall}}''
| style="background:#FFEE88" |Återinfektioner inträffade, med mindre förekomst än vaccinerade infektioner<ref name=":7">{{Webbref|url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/1005395/23_July_2021_Risk_assessment_for_SARS-CoV-2_variant_Delta.pdf|titel=Risk assessment for SARS-CoV-2 variant: Delta|hämtdatum=27 november 2021|datum=23 juli 2021|utgivare=Public Health England}}</ref>
| style="background:#ffcc88" |Effektminskning för icke-svår sjukdom<ref name=":7" /><ref>{{Webbref|titel=Weekly epidemiological update on COVID-19 - 20 July 2021|url=https://www.who.int/publications/m/item/weekly-epidemiological-update-on-covid-19---20-july-2021|verk=www.who.int|hämtdatum=2021-11-27|språk=en}}</ref>{{Anm|Måttligt minskad neutralisering med Covaxin.}}
|-
|[[Sars-cov-2 omikron|Omikron]]
|B.1.1.529
|21K
|[[Sydafrika]]
|9 nov 2021<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Heavily mutated Omicron variant puts scientists on alert|url=https://www.nature.com/articles/d41586-021-03552-w|tidskrift=Nature|år=2021-11-25|hämtdatum=2021-11-27|doi=10.1038/d41586-021-03552-w|språk=en|förnamn=Ewen|efternamn=Callaway}}</ref>
|26 nov 2021<ref name=":21">{{Webbref|titel=Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern|url=https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern|verk=www.who.int|hämtdatum=2021-11-27|språk=en}}</ref>
| style="background:#ffaaaa" |Ja
|P681H, N440K, N501Y, S477N och flera andra<ref>{{Webbref|url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/1036501/Technical_Briefing_29_published_26_November_2021.pdf|titel=SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England, technical briefing 29|hämtdatum=26 november 2021|datum=26 november 2021|utgivare=Public Health England}}</ref>
| style="background:#ffaaaa" | Eventuellt ökad risk<ref name=":21" />
| style="background:#ccffcc" |−57% {{Abbr|(59–61%)|95% säkerhetsintervall}} relativt till Delta.<ref>{{Webbref|titel=Report 50 - Hospitalisation risk for Omicron cases in England|url=http://www.imperial.ac.uk/medicine/departments/school-public-health/infectious-disease-epidemiology/mrc-global-infectious-disease-analysis/covid-19/report-50-severity-omicron/|verk=Imperial College London|hämtdatum=2022-02-21|språk=en-GB}}</ref><ref>{{Webbref|url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/1043840/22-december-2021-risk-assessment-for-SARS-Omicron_VOC-21NOV-01_B.1.1.529.pdf|titel=Risk assessment for SARS-CoV-2 variant: Omicron VOC-21NOV-01 (B.1.1.529)|hämtdatum=21 februari 2022|datum=22 december 2021|utgivare=UK Health Security Agency}}</ref>
| style="background:#ccffcc" |−63% {{Abbr|(69–74%)|95% säkerhetsintervall}} relativt till Deltavarianten.<ref>{{Webbref|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8926413|titel=Comparative analysis of the risks of hospitalisation and death associated with SARS-CoV-2 omicron (B.1.1.529) and delta (B.1.617.2) variants in England: a cohort study|hämtdatum=2024-04-26|datum=2022-04-02|utgivare=Lancet}}</ref>
| style="background:#ffaaaa" |Kraftigt ökad smittsamhet<ref>{{Webbref|url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/1043840/22-december-2021-risk-assessment-for-SARS-Omicron_VOC-21NOV-01_B.1.1.529.pdf|titel=Risk assessment for SARS-CoV-2 variant Omicron|hämtdatum=2024-04-26|datum=2021-12-22|utgivare=Public Health England}}</ref>
| style="background:#ffcc88" |Reducerad risk för symtomatisk sjukdom, okänd mot svår sjukdom
|-
|[[Sars-cov-2 alfa|Alfa]]
|B.1.1.7
|20I (V1)
|[[Storbritannien]]
|20 sep 2020<ref>{{Webbref|titel=Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations|url=https://virological.org/t/preliminary-genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-the-uk-defined-by-a-novel-set-of-spike-mutations/563|verk=Virological|datum=2020-12-18|hämtdatum=2021-11-27|språk=en}}</ref>
|18 dec 2020<ref>{{Webbref|url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/959438/Technical_Briefing_VOC_SH_NJL2_SH2.pdf|titel=Investigation of novel SARS-COV-2 variant - 
Variant of Concern 202012/01|hämtdatum=6 juni 2021|datum=21 December 2020|utgivare=Public Health England}}</ref>
| style="background:#ccffcc" |Nej
|69–70del, N501Y, P681H<ref name=":0">{{Webbref|titel=Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-03-21|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref><ref name=":18">{{Webbref|url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/959438/Technical_Briefing_VOC_SH_NJL2_SH2.pdf|titel=Investigation of novel SARS-COV-2
variant
Variant of Concern 202012/01|hämtdatum=21 mars 2021|utgivare=Public Health England|sid=6}}</ref>
| style="background:#ffaaaa" | +29% {{Abbr|(24–33%)|95% säkerhetsintervall}}<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Estimated transmissibility and impact of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 in England|efternamn=Davies|förnamn6=James D.|efternamn5=Kucharski|förnamn5=Adam J.|efternamn4=Jarvis|förnamn4=Christopher I.|efternamn3=Barnard|förnamn3=Rosanna C.|efternamn2=Abbott|förnamn2=Sam|förnamn=Nicholas G.|url=https://science.sciencemag.org/content/372/6538/eabg3055|språk=en|pmid=33658326|doi=10.1126/science.abg3055|nummer=6538|volym=372|issn=0036-8075|hämtdatum=2021-06-06|år=2021-04-09|tidskrift=Science|efternamn6=Munday}}</ref>
| style="background:#ffaaaa" | +52% {{Abbr|(47–57%)|95% säkerhetsintervall}}{{Anm|En annan studie,<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Risk of mortality in patients infected with SARS-CoV-2 variant of concern 202012/1: matched cohort study|förnamn2=Ellen|förnamn6=Leon|efternamn5=Tsaneva-Atanasova|förnamn5=Krasimira|efternamn4=Dyson|förnamn4=Louise|efternamn3=Read|förnamn3=Jonathan M|efternamn2=Brooks-Pollock|efternamn=Challen|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7941603/|förnamn=Robert|pmid=33687922|pmc=7941603|doi=10.1136/bmj.n579|volym=372|issn=0959-8138|hämtdatum=2021-05-27|år=2021-03-10|tidskrift=The BMJ|efternamn6=Danon}}</ref> har uppskattat att B.1.1.7 kan vara ~64% (32–104%) mer dödlig.}}
| style="background:#ffaaaa" | +59% {{Abbr|(44–74%)|95% säkerhetsintervall}}
| style="background:#ccffcc" |Minimal minskning<ref name=":19">{{Webbref|titel=Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/variants/variant-info.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-07-15|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref>
| style="background:#ccffcc" |Minimal minskning
|-
|[[Sars-cov-2 gamma|Gamma]]
|P.1
|20J (V3)
|[[Brasilien]]
|nov 2020
|15 jan 2021<ref>{{Webbref|titel=Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK|url=https://www.gov.uk/government/news/confirmed-cases-of-covid-19-variants-identified-in-uk|verk=GOV.UK|hämtdatum=2021-06-06|språk=en}}</ref><ref>{{Webbref|titel=NERVTAG: Note on variant P.1, 27 January 2021|url=https://www.gov.uk/government/publications/nervtag-note-on-variant-p1-27-january-2021|verk=GOV.UK|hämtdatum=2021-06-06|språk=en}}</ref>
| style="background:#ccffcc" |Nej
|K417N, E484K, N501Y<ref name=":0" />
| style="background:#ffaaaa" | +38% {{Abbr|(29–48%)|95% säkerhetsintervall}}<ref name=":22">{{Webbref|titel=SAGE 89 minutes: Coronavirus (COVID-19) response, 13 May 2021|url=https://www.gov.uk/government/publications/sage-89-minutes-coronavirus-covid-19-response-13-may-2021/sage-89-minutes-coronavirus-covid-19-response-13-may-2021|verk=GOV.UK|hämtdatum=2021-05-27|språk=en}}</ref>{{Anm|Möjligen 50% mer smittsam än Variant B.1.1.7.}}
| style="background:#FFEE88" |Eventuellt ökad risk.<ref name=":23">{{Tidskriftsref|rubrik=Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil|url=https://science.sciencemag.org/content/early/2021/04/13/science.abh2644|tidskrift=Science|år=2021-04-14|hämtdatum=2021-04-18|issn=0036-8075|doi=10.1126/science.abh2644|pmid=33853970|språk=en|förnamn=Nuno R.|efternamn=Faria|förnamn2=Thomas A.|efternamn2=Mellan|förnamn3=Charles|efternamn3=Whittaker|förnamn4=Ingra M.|efternamn4=Claro|förnamn5=Darlan da S.|efternamn5=Candido|förnamn6=Swapnil|efternamn6=Mishra}}</ref>{{Anm|Det rapporterade konfidentiella eller trovärdiga intervallet har en låg sannolikhet, så det uppskattade värdet kan bara förstås som möjligt, inte säkert eller troligt.}}
| style="background:#ffcc88" | +50% {{Abbr|(20–90%)|95% säkerhetsintervall}}
| style="background:#FFEE88" |Reducerad<ref name=":19" />
| style="background:#ccffcc" |Behålls av många{{Anm|Förutom Pfizer – BioNTech.}}
|-
|[[Sars-cov-2 beta|Beta]]
|B.1.351
|20H (V2)
|[[Sydafrika]]
|maj 2020
|14 jan 2021<ref>{{Webbref|titel=NERVTAG: Brief note on SARS-CoV-2 variants, 13 January 2021|url=https://www.gov.uk/government/publications/nervtag-brief-note-on-sars-cov-2-variants-13-january-2021|verk=GOV.UK|hämtdatum=2021-06-06|språk=en}}</ref>
| style="background:#ccffcc" |Nej
|K417N, E484K, N501Y<ref name=":0" />
| style="background:#ffaaaa" | +25% {{Abbr|(20–30%)|95% säkerhetsintervall}}<ref name=":2">{{Webbref|url=https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/COVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEA-first-update.pdf|titel=Risk related to the spread of new
SARS-CoV-2 variants of concern
in the EU/EEA – first update|hämtdatum=21 mars 2021|datum=21 januari 2021|utgivare=ECDC}}</ref>
|''Under utredning''
| style="background:#FFEE88" |Eventuellt ökad risk
| style="background:#FFEE88" |Reducerad T-cellrespons framkallat av D614G-virus förblir effektivt<ref name=":19" /><ref name=":20">{{Webbref|titel=Weekly epidemiological update on COVID-19 - 22 June 2021|url=https://www.who.int/publications/m/item/weekly-epidemiological-update-on-covid-19---22-june-2021|verk=www.who.int|hämtdatum=2021-07-15|språk=en}}</ref>
| style="background:#ffcc88" |Reducerad risk för symtomatisk sjukdom, bibehålls mot svår sjukdom
|}{{anmärkningslista}}

== Referenssekvens ==
Sekvensen ''WIV04/2019'', som tillhör [[GISAID]] S [[Kladistik|kladen]] / [[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|PANGOLIN]] A kladen / [[Nextstrain]] 19B kladen, tros vara den originella sekvensen som smittar människor, känd som "sekvens noll" (sequence zero).<ref name="rendus">{{Tidskriftsref|rubrik=Origin, evolution and global spread of SARS-CoV-2|förnamn2=Luc|förnamn6=Olivier|efternamn5=Voznica|förnamn5=Jakub|efternamn4=Morel|förnamn4=Marie|efternamn3=Lemoine|förnamn3=Frédéric|efternamn2=Blassel|efternamn=Zhukova|url=https://comptes-rendus.academie-sciences.fr/biologies/item/CRBIOL_0__0_0_A1_0/|förnamn=Anna|doi=10.5802/crbiol.29|nummer=0|volym=0|sid=1–19|hämtdatum=2021-01-31|år=0|tidskrift=Comptes Rendus. Biologies|efternamn6=Gascuel|arkivurl=https://web.archive.org/web/20210221205942/https://comptes-rendus.academie-sciences.fr/biologies/item/CRBIOL_0__0_0_A1_0/|arkivdatum=2021-02-21}}</ref> Sekvensen ''WIV04/2019'' sekvenserades från en symptomatisk patient den 30 december 2019 och är en referenssekvens.<ref name="rendus"/> Dock refererar en annan grupp (Sudhir Kumar m.fl.),<ref name=":4">{{Webbref|url=https://academic.oup.com/mbe/advance-article/doi/10.1093/molbev/msab118/6257226|titel=An evolutionary portrait of the progenitor SARS-CoV-2 and its dominant offshoots in COVID-19 pandemic|hämtdatum=17 maj 2021|datum=4 maj 2021|utgivare=Molecular Biology and Evolution|författare=Sudhir Kumar et al.}}</ref> till [[National Center for Biotechnology Information|NCBI]] referensgenomet (GenBankID:NC_045512; GISAID ID: EPI_ISL_402125),<ref>{{Webbref|url=https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32015508/|titel=A new coronavirus associated with human respiratory disease in China|hämtdatum=17 maj 2021|datum=3 februari 2020|utgivare=NIH, National Library of Medicine|författare=Fan Wu, Su Zhao, Bin Yu, Yan-Mei Chen, Wen Wang, Zhi-Gang Song, Yi Hu, Zhao-Wu Tao, Jun-Hua Tian, Yuan-Yuan Pei, Ming-Li Yuan, Yu-Ling Zhang, Fa-Hui Dai, Yi Liu, Qi-Min Wang, Jiao-Jiao Zheng, Lin Xu, Edward C Holmes, Yong-Zhen Zhang}}</ref> denna sekvens samlades in den 26 december 2019,<ref>{{Webbref|url=https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33605421/|titel=Comparative genomics reveals early emergence and biased spatio-temporal distribution of SARS-CoV-2|hämtdatum=17 maj 2021|datum=19 februari 2021|utgivare=NIH, National Library of Medicine|författare=Matteo Chiara, David S Horner, Carmela Gissi, Graziano Pesole}}</ref> dock använde denna gruppen också ''WIV04'' GISAID referensgenomet med (ID: EPI_ISL_402124)<ref>{{Webbref|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7095418|titel=A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin|hämtdatum=17 maj 2021|datum=3 februari 2020|utgivare=Nature, PMC|författare=Zhengli, Shi et al.}}</ref> i sin analys.<ref>{{Webbref|url=https://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.8.2000097|titel=Early transmission patterns of coronavirus disease 2019 (COVID-19) in travellers from Wuhan to Thailand, January 2020|hämtdatum=17 maj 2021|datum=februari 2020|utgivare=Euro Surveill.|författare=Okada Pilailuk, Buathong Rome, Phuygun Siripaporn, Thanadachakul Thanutsapa, Parnmen Sittiporn, Wongboot Warawan, Waicharoen Sunthareeya, Wacharapluesadee Supaporn, Uttayamakul Sumonmal, Vachiraphan Apichart, Chittaganpitch Malinee, Mekha Nanthawan, Janejai Noppavan, Iamsirithaworn Sopon, Lee Raphael TC, Maurer-Stroh Sebastian.}}</ref> Den äldsta sekvensen, ''Wuhan-1'', samlades in den 24 december 2019.<ref name=":4" />

== Kriteria för notabilitet ==
Vissa av de potentiella konsekvenserna av dessa varianter av särskild betydelse är följande:<ref name=":15">{{Webbref|titel=Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/science/science-briefs/scientific-brief-emerging-variants.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-05-17|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref><ref>{{Webbref|titel=COVID “Mega-variant” and eight criteria for a template to assess all variants|url=https://sciencespeaksblog.org/2021/02/02/covid-mega-variant-and-eight-criteria-for-a-template-to-assess-all-variants/|verk=Science Speaks: Global ID News|datum=2021-02-02|hämtdatum=2021-05-22|språk=en-US|förnamn=IDSA|efternamn=Contributor|arkivurl=https://web.archive.org/web/20210421035437/https://sciencespeaksblog.org/2021/02/02/covid-mega-variant-and-eight-criteria-for-a-template-to-assess-all-variants/|arkivdatum=2021-04-21}}</ref>

* Mer [[Virulens|smittsam]]
* Ökad [[mortalitet]]
* Ökad [[morbiditet]]
* Ökad risk för [[långtidscovid]]
* Förmågan att vara gömd i diagnostiska tester
* Minskad känslighet mot [[Antiviralt medel|antivirala medel]]
* Minskad känslighet mot neutralisering av [[antikropp]]ar
* Förmågan att kringgå naturlig immunitet
* Förmågan att smitta vaccinerade personer
* Ökad risk för vissa sjukdomar, såsom [[systemiskt inflammationsresponssyndrom]]
* Ökad [[affinitet]] för särskilda demografiska eller kliniska grupper, såsom barn eller personer som lider av [[immunsuppression]]

== Varianter av särskilt intresse ==
=== Alfa: Variant B.1.1.7 ===
{{Huvudartikel|SARS-CoV-2-Alfa}}
Varianten upptäckes i oktober 2020 i Storbritannien i ett testprov taget månaden tidigare,<ref>{{Tidningsref|rubrik=Covid: Nations impose UK travel bans over new variant|url=https://www.bbc.com/news/world-europe-55385768|tidning=BBC News|datum=2020-12-20|hämtdatum=2021-01-31|språk=en-GB}}</ref> tidigare nämnd som Variant Under Investigation in December 2020 (VUI – 202012/01)<ref>{{Webbref|titel=PHE investigating a novel variant of COVID-19|url=https://www.gov.uk/government/news/phe-investigating-a-novel-variant-of-covid-19|verk=GOV.UK|hämtdatum=2021-01-31|språk=en}}</ref> och som lineage B.1.1.7 eller 20I/501Y.V1 (tidigare 20B/501Y.V1).<ref>{{Webbref|titel=Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-01-31|språk=en-us}}</ref> Den korrelerar med den betydliga ökningen av bekräftade fall av Covid-19 i Storbritannien{{När/sub|datum=2021-06}} och associeras dels med N501Y-mutationen. Det finns vissa belägg som visar att denna varianten har en smittsamhet som är mellan 30 och 70 procent högre än andra mutationer och tidigare studier visar också en ökning i dödlighet.<ref>{{Tidningsref|rubrik=Coronavirus: UK variant 'may be more deadly'|url=https://www.bbc.com/news/health-55768627|tidning=BBC News|datum=2021-01-22|hämtdatum=2021-01-31|språk=en-GB}}</ref> Denna variant har av Världshälsoorganisationen fått beteckningen ''alfa''.<ref name=":16">{{Webbref|titel=Tracking SARS-CoV-2 variants|url=https://www.who.int/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants|verk=www.who.int|hämtdatum=2021-06-06|språk=en}}</ref>

==== B.1.1.7 med E484K ====
Variant of Concern 21FEB-02, tidigare benämnd som VOC-202102/02, beskriven av [[Public Health England]] som B.1.1.7 med E484K,<ref name=":3">{{Webbref|titel=Variants: distribution of cases data|url=https://www.gov.uk/government/publications/covid-19-variants-genomically-confirmed-case-numbers/variants-distribution-of-cases-data|verk=GOV.UK|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref> är av samma variant i [[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|PANGO]]:s nomenklatursystem men har ytterligare en E484K mutation. Sedan den 17 mars 2021 har det bekräftats 39 fall av VOC-21FEB-02 i Storbritannien.<ref name=":3" /> Den 4 mars 2021 rapporterade forskare att B.1.1.7 med E484K mutationen hade upptäckts i [[Oregon]] i [[USA]]. I 13 provtester analyserade hade en sekvens denna kombinationen, som tros ha muterat av sig själv spontant och lokalt – vilket betyder att mutationen inte tros vara importerad.<ref>{{Tidningsref|rubrik=In Oregon, Scientists Find a Virus Variant With a Worrying Mutation|url=https://www.nytimes.com/2021/03/05/health/virus-oregon-variant.html|tidning=The New York Times|datum=2021-03-05|hämtdatum=2021-05-17|issn=0362-4331|språk=en-US|förnamn=Apoorva|efternamn=Mandavilli}}</ref><ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Resistance of SARS-CoV-2 variants to neutralization by monoclonal and serum-derived polyclonal antibodies|url=https://www.nature.com/articles/s41591-021-01294-w|tidskrift=Nature Medicine|år=2021-04|hämtdatum=2021-05-17|issn=1546-170X|sid=717–726|volym=27|nummer=4|doi=10.1038/s41591-021-01294-w|språk=en|förnamn=Rita E.|efternamn=Chen|förnamn2=Xianwen|efternamn2=Zhang|förnamn3=James Brett|efternamn3=Case|förnamn4=Emma S.|efternamn4=Winkler|förnamn5=Yang|efternamn5=Liu|förnamn6=Laura A.|efternamn6=VanBlargan}}</ref><ref>{{Webbref|titel=outbreak.info|url=https://outbreak.info/|verk=outbreak.info|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref>

=== Beta: Variant B.1.351 ===
{{Huvudartikel|SARS-CoV-2-Beta}}
Den 18 december 2020 upptäcktes variant B.1.351, även kallad 501.V2, 20H/501Y.V2 (tidigare 20C/501Y.V2), eller lineage B.1.351 på engelska,<ref name="cdc"/> i [[Sydafrika]].<ref name="nyt">{{Tidningsref|rubrik=South Africa announces a new coronavirus variant.|url=https://www.nytimes.com/2020/12/19/world/south-africa-announces-a-new-coronavirus-variant.html|tidning=The New York Times|datum=2020-12-18|hämtdatum=2021-01-31|issn=0362-4331|språk=en-US|förnamn=Sheri|efternamn=Fink}}</ref> Forskare och tjänstemän rapporterade att varianten spreds i större utsträckning bland yngre utan några bakomliggande sjukdomar och till skillnad från andra varianter leder denna varianten till mer allvarliga sjukdomsförlopp i större omfattning.<ref>{{Webbref|titel=Update On Covid-19 (18th December 2020) - SA Corona Virus Online Portal|url=https://sacoronavirus.co.za/2020/12/18/update-on-covid-19-18th-december-2020/|verk=SA Corona Virus  Online Portal|hämtdatum=2021-01-31|språk=en-ZA}}</ref> Varianten korrelerar också med den betydliga ökningen av bekräftade fall av Covid-19 i Sydafrika.<ref name="nyt"/> Denna variant har av Världshälsoorganisationen fått beteckningen ''beta''.<ref name=":16" />

=== Gamma: Variant P.1 ===
{{Huvudartikel|SARS-CoV-2-Gamma}}
Variant P.1 (Lineage P1), upptäcktes i Tokyo den 6 januari 2021. Den upptäcktes först hos fyra personer som anlände i Tokyo efter att ha rest från [[Amazonas (delstat i Brasilien)|Amazonas]] i Brasilien den 2 januari 2021.<ref>{{Webbref|titel=Japan finds new coronavirus variant in travelers from Brazil|url=https://japantoday.com/category/national/corrected-update-3-japan-finds-new-coronavirus-variant-in-travellers-from-brazil|verk=Japan Today|hämtdatum=2021-01-31|språk=en}}</ref> Den 12 januari 2021 rapporterade Brasiliens folkhälsomyndighet 13 bekräftade fall av varianten i [[Manaus]].<ref name="man">{{Webbref|titel=Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings|url=https://virological.org/t/genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings/586|verk=Virological|datum=2021-01-12|hämtdatum=2021-01-31|språk=en}}</ref> Varianten fanns inte i sekvenserade prover från mars till november 2020 men identifierades i 42 % av sekvenserade prover från december 2020.<ref name="man"/> Denna variant har av Världshälsoorganisationen fått beteckningen ''gamma''.<ref name=":16" />

Det har även identifierats en annan variant i [[Rio de Janeiro]], Brasilien, som nu döpts till Variant P.2,<ref name="pang">{{Webbref|titel=PANGO lineages|url=https://cov-lineages.org/lineages/lineage_P.2.html|verk=cov-lineages.org|hämtdatum=2021-01-31|arkivurl=https://web.archive.org/web/20210428155052/https://cov-lineages.org/lineages/lineage_P.2.html|arkivdatum=2021-04-28}}</ref> som har mutationen E484K. Variant P.2 är inte direkt relaterad till variant P.1 men båda har mutationen E484K.<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil|förnamn2=Ronaldo da Silva|förnamn6=Alexandra L.|efternamn5=Brustolini|förnamn5=Otavio J.|efternamn4=Cardoso|förnamn4=Cynthia C.|efternamn3=Almeida|förnamn3=Luiz G. P. de|efternamn2=F|efternamn=Voloch|url=https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.12.23.20248598v1|förnamn=Carolina M.|språk=en|doi=10.1101/2020.12.23.20248598|sid=2020.12.23.20248598|issn=2024-8598|hämtdatum=2021-01-31|år=2020-12-26|tidskrift=medRxiv|efternamn6=Gerber}}</ref>

=== Delta: Variant B.1.617.2 ===
{{Huvudartikel|SARS-CoV-2-Delta}}
Variant B.1.617, kallas även i folkmun "indiska dubbelmutationen",<ref>{{Webbref|titel=Dubbelmutationen har kommit till Europa: Extra orolig|url=https://www.aftonbladet.se/a/aPn4lM|verk=Aftonbladet|hämtdatum=2021-04-18|språk=sv}}</ref> är en mutation som först upptäcktes i [[Indien]] runt oktober 2020. I januari 2021 var det endast ett fåtal bekräftade fall av mutationen och fram till april hade mutationen spridits till 20 länder i alla kontinenter förutom antarktis och sydamerika.<ref name="pang"/><ref name="in"/><ref>{{Webbref|titel=India's variant-fuelled second wave coincided with spike in infected flights landing in Canada|url=https://torontosun.com/news/local-news/indias-variant-fuelled-second-wave-coincided-with-spike-in-infected-flights-landing-in-canada|verk=torontosun|hämtdatum=2021-04-18|språk=en-CA}}</ref> Varianten har 15 olika definierade mutationer varav några av spikeproteins-mutationerna P681R, E484Q<ref>{{Webbref|titel=IS THIS COVID – 20? {{!}} Double Mutant Strain Explained|url=https://selfimmune.com/2021/04/17/double-mutant-strain-explained/|verk=Self Immune|datum=2021-04-17|hämtdatum=2021-04-18|språk=en-US|efternamn=Shrutirupa}}</ref> och L452R,<ref>{{Tidningsref|rubrik='Double mutant': What are the risks of India's new Covid-19 variant|url=https://www.bbc.com/news/world-asia-india-56517495|tidning=BBC News|datum=2021-03-25|hämtdatum=2021-04-18|språk=en-GB}}</ref> de sista två förenklar virusets möjlighet att undvika antikroppar vilket kan göra vaccin ineffektiva.<ref>{{Webbref|titel=An Indian SARS-CoV-2 Variant Lands In California. More Danger Ahead?|url=https://www.forbes.com/sites/williamhaseltine/2021/04/12/an-indian-sars-cov-2-variant-lands-in-california-more-danger-ahead/|verk=Forbes|hämtdatum=2021-04-18|språk=en|förnamn=William A.|efternamn=Haseltine}}</ref> 

Den 15 april meddelade Public Health England (PHE) att varianten kom till att bli "Variant under Investigation", VUI-21APR-01.<ref>{{Webbref|titel=Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK|url=https://www.gov.uk/government/news/confirmed-cases-of-covid-19-variants-identified-in-uk|verk=GOV.UK|hämtdatum=2021-04-18|språk=en}}</ref> Undervarianten B.1.617.2 har av Världshälsoorganisationen fått beteckningen ''delta''. Undervarianten B.1.617.1 har fått beteckningen ''kappa''<ref name=":16" />

== Andra varianter av intresse ==
=== Epsilon: Variant B.1.429 / CAL.20C ===
{{Huvudartikel|SARS-CoV-2-Epsilon}}
CAL.20C<ref>{{Webbref|titel=Local COVID-19 Strain Found in Over One-Third of Los Angeles Patients|url=https://www.cedars-sinai.org/newsroom/local-covid-19-strain-found-in-over-one-third-of-los-angeles-patients/|verk=Local COVID-19 Strain Found in Over One-Third of Los Angeles Patients|hämtdatum=2021-01-31|språk=en-us|arkivurl=https://web.archive.org/web/20210131072526/https://www.cedars-sinai.org/newsroom/local-covid-19-strain-found-in-over-one-third-of-los-angeles-patients/|arkivdatum=31 januari 2021}}</ref> identifierades först av forskare i juli 2020 i ett prov av 1 230 prover som samlades in i [[Los Angeles County]]. Denna varianten som döpts till variant B.1.429, har mutationen L452R och upptäcktes inte igen innan oktober 2020. I november 2020 stod CAL.20C för 36% av alla sekvenserade prover och i januari 2021 stod varianten för ungefär 50% av alla sekvenserade prover.<ref>{{Tidningsref|rubrik=New California Variant May Be Driving Virus Surge There, Study Suggests|url=https://www.nytimes.com/2021/01/19/health/coronavirus-variant-california.html|tidning=The New York Times|datum=2021-01-19|hämtdatum=2021-01-31|issn=0362-4331|språk=en-US|förnamn=Carl|efternamn=Zimmer}}</ref> Varianten har också upptäckts i andra delar av norra Kalifornien. Mellan november och december 2020 ökade varianten från 3% till 25% i alla sekvenserade prover.<ref>{{Webbref|titel=New strains of COVID swiftly moving through the US need careful watch, scientists say|url=https://www.usatoday.com/story/news/health/2021/01/22/covid-new-virus-mutations-but-vaccines-fight-outbreak/4216815001/|verk=USA TODAY|hämtdatum=2021-01-31|språk=en-US|förnamn=Karen Weintraub and Elizabeth|efternamn=Weise}}</ref>

=== Zeta: Variant P.2 ===
{{Huvudartikel|SARS-CoV-2-Zeta}}
Variant P.2, är en undervariant av B.1.1.28 likt P.1, som först upptäcktes i staten [[Rio de Janeiro (delstat)|Rio de Janeiro]]. Den bär på mutationen E484K men inte på N501Y och K417T.<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil|förnamn2=Ronaldo da Silva|förnamn6=Alexandra L.|efternamn5=Brustolini|förnamn5=Otavio J.|efternamn4=Cardoso|förnamn4=Cynthia C.|efternamn3=Almeida|förnamn3=Luiz G. P. de|efternamn2=F|efternamn=Voloch|url=https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.12.23.20248598v1|förnamn=Carolina M.|språk=en|doi=10.1101/2020.12.23.20248598|sid=2020.12.23.20248598|issn=2024-8598|hämtdatum=2021-06-10|år=2020-12-26|tidskrift=medRxiv|efternamn6=Gerber}}</ref> Variant P.2 utvecklades självständigt i Rio De Janeiro utan att vara relaterad till Variant P.1 från Manaus.<ref>{{Webbref|titel=Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings|url=https://virological.org/t/genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings/586|verk=Virological|datum=2021-01-12|hämtdatum=2021-06-10|språk=en}}</ref><ref>{{Webbref|titel=PANGO lineages|url=https://cov-lineages.org/lineages/lineage_P.2.html|verk=cov-lineages.org|hämtdatum=2021-06-10|arkivurl=https://web.archive.org/web/20210428155052/https://cov-lineages.org/lineages/lineage_P.2.html|arkivdatum=2021-04-28}}</ref>

Varianten döptes av Världshälsoorganisationen till variant Zeta och uppskattas vara en variant av intresse, men inte en variant av särskild betydelse vid detta tillfälle.<ref name=":6">{{Webbref|titel=Tracking SARS-CoV-2 variants|url=https://www.who.int/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants|verk=www.who.int|hämtdatum=2021-06-10|språk=en}}</ref>

=== Eta: Variant B.1.525 ===
{{Huvudartikel|SARS-CoV-2-Eta}}
B.1.525, också benämnd som VUI-21FEB-03,<ref name=":3" /> (tidigare VUI-202102/03) av Public Health England (PHE) och tidigare känd som UK1188.<ref name=":3" /> Den har inte samma N501Y mutation som återfinns hos [[Variant B.1.1.7|B.1.1.7]], [[Variant B.1.351|B.1.351]] och [[Variant P.1|P.1]], men har samma E484K-mutation som återfinns hos P.1, [[Variant P.2|P.2]] och B.1.351. Den har också samma ΔH69/ΔV70 [[Mutation|deletion]] som återfinns hos B.1.1.7, N439K varianterna B.1.141 och B.1.258 samt Y453F varianten [[Kluster 5]].<ref>{{Webbref|titel=Delta-PCR-testen|url=https://covid19.ssi.dk/diagnostik/delta-pcr-testen|verk=covid19.ssi.dk|hämtdatum=2021-05-17|språk=da|efternamn=name}}</ref> B.1.525 skiljer sig från alla andra varianter genom att ha båda E484K-mutationerna och en ny F888L-mutation som gör en [[Mutation|substitution]] av [[Fenylalanin]] (F) och [[Leucin]] (L) i S2 domänet av spikeproteinet. Sedan den 5 mars 2021 har den upptäckts i 23 länder såsom: [[Storbritannien]], [[Danmark]], [[Finland]], [[Norge]], [[Nederländerna]], [[Belgien]], [[Frankrike]], [[Spanien]], [[Nigeria]], [[Ghana]], [[Jordanien]], [[Japan]], [[Singapore]], [[Australien]], [[Kanada]], [[Tyskland]], [[Italien]], [[Slovenien]], [[Österrike]], [[Schweiz]], [[Malaysia]], [[Irland]] och [[USA]].<ref name=":9">{{Webbref|titel=GISAID - hCov19 Variants|url=https://www.gisaid.org/hcov19-variants/|verk=www.gisaid.org|hämtdatum=2021-05-17}}</ref><ref name=":10">{{Webbref|url=https://files.ssi.dk/covid19/virusvarianter/status/status-virusvarianter-27022021-l9k7|titel=Status for udvikling af SARS-CoV-2 Variants of Concern (VOC) i Danmark|hämtdatum=17 maj 2021|datum=27 februari 2021|utgivare=Statens Serum Institut}}</ref><ref>{{Webbref|titel=Varianten van het coronavirus SARS-CoV-2 {{!}} RIVM|url=https://www.rivm.nl/coronavirus-covid-19/virus/varianten|verk=www.rivm.nl|hämtdatum=2021-05-17}}</ref><ref name=":11">{{Webbref|titel=Lineage B.1.525|url=https://cov-lineages.org/global_report_B.1.525.html|verk=cov-lineages.org|hämtdatum=2021-05-17}}</ref><ref>{{Webbref|titel=A coronavirus variant with a mutation that 'likely helps it escape' antibodies is already in at least 11 countries, including the US|url=https://www.businessinsider.com/virus-variant-in-11-countries-and-may-resist-antibodies-report-2021-2|verk=Business Insider|hämtdatum=2021-05-17|språk=en-US|förnamn=Marianne|efternamn=Guenot}}</ref><ref>{{Webbref|titel=En ny variant av koronaviruset er oppdaget i Norge. Dette vet vi.|url=https://www.aftenposten.no/norge/i/0Koll2/en-ny-variant-av-koronaviruset-er-oppdaget-i-norge-hva-vet-vi-om-den|verk=www.aftenposten.no|hämtdatum=2021-05-17|språk=nb}}</ref><ref>{{Webbref|titel=Coronavirus: Variant discovered in UK and Nigeria found in State for first time|url=https://www.irishtimes.com/news/health/coronavirus-variant-discovered-in-uk-and-nigeria-found-in-state-for-first-time-1.4495002|verk=The Irish Times|hämtdatum=2021-05-17|språk=en|förnamn=Paul|efternamn=Cullen}}</ref> Den har också upptäckts i [[Mayotte]].<ref name=":9" /> De första fallen av varianten upptäcktes i december 2020 i Storbritannien och Nigeria och sedan den 15 februari har den upptäckts främst i Nigeria.<ref name=":11" /> Sedan den 24 februari 2021 har 56 fall bekräftats i Storbritannien.<ref>{{Webbref|titel=Variants: distribution of cases data|url=https://www.gov.uk/government/publications/covid-19-variants-genomically-confirmed-case-numbers/variants-distribution-of-cases-data|verk=GOV.UK|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref> Danmark som sekvenserar alla sina Covid-19-fall har hittat 113 fall av denna varianten mellan 14 januari till den 21 februari 2021, varav 7 av dessa är direkt kopplade till resor till Nigeria.<ref name=":10" /> Denna variant har av Världshälsoorganisationen fått beteckningen Eta.<ref name=":16" />

Experter i Storbritannien studerar varianten för att förstå hur stor risk den kan ha på människan. Den är idag klassificerad som en variant av intresse men kan komma att bli en variant av särskild betydelse.<ref name=":6" />

=== Theta: Variant P.3 ===
{{Huvudartikel|SARS-CoV-2-Theta}}''Den 18 februari 2021 rapporterade [[Filippinerna]]s hälsomyndighet att de upptäckt två nya mutationer av Covid-19 i [[Centrala Visayas]] efter provtester från patienter skickats för att genomgå en genomsekvensering. Mutationerna visade sig sedan vara E484K och N501Y som upptäcktes i 37 av 50 provtester. Båda mutationerna existerade i samma provsvar hos 29 av dessa 37 provtesterna. Det fanns inga officiella namn för dessa varianterna och den fulla sekvensen hade inte identifierats ännu vid tillfället.<ref>{{Webbref|titel=DOH confirms detection of 2 SARS-CoV-2 mutations in Region 7|url=https://news.abs-cbn.com/news/02/18/21/doh-to-investigate-2-mutations-of-concern-found-in-cebu|verk=ABS-CBN News|datum=2021-02-18|hämtdatum=2021-05-17|språk=en|förnamn=ABS-CBN|efternamn=News}}</ref>''

Den 13 mars rapporterade Filippinernas hälsomyndighet att mutationen består av en variant som döptes till Variant P.3.<ref>{{Webbref|titel=DOH reports COVID-19 variant ‘unique’ to PH, first case of Brazil variant|url=https://cnnphilippines.com/news/2021/3/13/Philippines-new-COVID-19-variant-Brazil-UK-South-Africa.html|verk=cnn|hämtdatum=2021-05-17|språk=en|arkivurl=https://web.archive.org/web/20210316224353/https://cnnphilippines.com/news/2021/3/13/Philippines-new-COVID-19-variant-Brazil-UK-South-Africa.html|arkivdatum=2021-03-16}}</ref> Samma dag bekräftade även landet sitt första fall av [[Variant P.1|P.1]] i landet. Även om P.1- och P.3-varianterna kommer från samma ursprungsvariant, [[Variant P.1|B.1.1.28]], sade hälsomyndigheten att Variant P.3:s påverkan på vacciners effektivitet var okänd. Sedan den 13 mars har Filippinerna bekräftat 98 fall av P.3.<ref>{{Webbref|titel=DOH confirms new COVID-19 variant first detected in PH, first case of Brazil variant|url=https://news.abs-cbn.com/news/03/13/21/doh-confirms-new-covid-19-variant-first-detected-in-ph-first-case-of-brazil-variant|verk=ABS-CBN News|datum=2021-03-13|hämtdatum=2021-05-17|språk=en|förnamn=ABS-CBN|efternamn=News}}</ref> Den 12 mars upptäcktes varianten i [[Japan]].<ref>{{Webbref|titel=PH discovered new COVID-19 variant earlier than Japan, expert clarifies|url=https://cnnphilippines.com/news/2021/3/13/PH-COVID-19-variant-Japan.html|verk=cnn|hämtdatum=2021-05-17|språk=en|arkivurl=https://web.archive.org/web/20210317013626/https://www.cnnphilippines.com/news/2021/3/13/PH-COVID-19-variant-Japan.html|arkivdatum=2021-03-17}}</ref><ref>{{Webbref|titel=Japan detects new coronavirus variant from traveler coming from PH|url=https://cnnphilippines.com/news/2021/3/13/Japan-detects-new-coronavirus-variant-from-traveler-coming-from-PH.html?fbclid=lwAR2|verk=cnn|hämtdatum=2021-05-17|språk=en|arkivurl=https://web.archive.org/web/20210317014108/https://cnnphilippines.com/news/2021/3/13/Japan-detects-new-coronavirus-variant-from-traveler-coming-from-PH.html?fbclid=lwAR2|arkivdatum=2021-03-17}}</ref> Den 17 mars upptäckte Storbritannien sina första två fall,<ref>{{Webbref|titel=UK reports 2 cases of COVID-19 variant first detected in Philippines|url=https://news.abs-cbn.com/overseas/03/17/21/uk-reports-2-cases-of-covid-19-variant-first-detected-in-philippines|verk=ABS-CBN News|datum=2021-03-17|hämtdatum=2021-05-17|språk=en|förnamn=ABS-CBN|efternamn=News}}</ref> Public Health England döpte varianten till VUI-21MAR-02.<ref>{{Webbref|titel=Variants: distribution of cases data|url=https://www.gov.uk/government/publications/covid-19-variants-genomically-confirmed-case-numbers/variants-distribution-of-cases-data|verk=GOV.UK|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref> Den 30 april 2021 upptäckte [[Malaysia]] 8 fall av P.3 i [[Sarawak]].<ref>{{Webbref|titel=Covid-19: Sarawak detects variant reported in the Philippines|url=https://www.thestar.com.my/news/nation/2021/04/30/covid-19-sarawak-detects-variant-reported-in-the-philippines|verk=The Star|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref> Denna variant har av Världshälsoorganisationen fått beteckningen ''theta''.<ref name=":16" />

=== Jota: Variant B.1.526 ===
{{Huvudartikel|Sars-cov-2 jota}}
I november 2020 upptäcktes en muterad variant i [[New York]] som döptes till B.1.526.<ref>{{Tidningsref|rubrik=A New Coronavirus Variant Is Spreading in New York, Researchers Report|url=https://www.nytimes.com/2021/02/24/health/coronavirus-variant-nyc.html|tidning=The New York Times|datum=2021-02-24|hämtdatum=2021-05-17|issn=0362-4331|språk=en-US|förnamn=Apoorva|efternamn=Mandavilli}}</ref> Sedan den 11 april 2021 hade varianten upptäckts i 48 stater och 18 länder. Varianten följer samma mönster som B.1.429, dock kunde B.1.526 få snabbt fotfäste i vissa stater men under våren 2021 dominerade B.1.1.7 i USA och denna varianten stod för en väldigt liten del av de sekvenserade proverna.<ref>{{Tidningsref|rubrik=How the United States Beat the Variants, for Now|url=https://www.nytimes.com/2021/05/14/health/coronavirus-variants-united-states-of-america.html|tidning=The New York Times|datum=2021-05-14|hämtdatum=2021-05-17|issn=0362-4331|språk=en-US|förnamn=Carl|efternamn=Zimmer|förnamn2=Apoorva|efternamn2=Mandavilli}}</ref> Denna variant har av Världshälsoorganisationen fått beteckningen ''Iota.<ref name=":16" />''

=== Kappa: Variant B.1.617.1 ===
{{Huvudartikel|SARS-CoV-2-Kappa}}
Variant B.1.617.1 är en av tre undervarianter från Variant B.1.617. Varianten upptäcktes först i Indien i december 2020.<ref>{{Webbref|url=https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20210427_weekly_epi_update_37.pdf?sfvrsn=a1ab459c_9&download=true|titel=Weekly epidemiological update on COVID-19 - 27 April 2021|hämtdatum=10 juni 2021|datum=27 april 2021|utgivare=WHO}}</ref> I slutet av mars 2021 stod Kappa-varianten för närmare hälften av alla sekvenserade fall från Indien.<ref>{{Webbref|titel=Indian covid-19 variant (B.1.617)|url=https://www.newscientist.com/definition/indian-covid-19-variant-b-1-617/|verk=New Scientist|hämtdatum=2021-06-10|språk=en-US|förnamn=Michael Le|efternamn=Page}}</ref> Den 1 april 2021 förklarades varianten som en variant under utredningen ('''VUI-21APR-01''') av [[Public Health England]]''.<ref>{{Webbref|url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/984274/Variants_of_Concern_VOC_Technical_Briefing_10_England.pdf|titel=SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England - Technical briefing 10|hämtdatum=10 juni 2021|datum=7 maj 2021|utgivare=Public Health England}}</ref>''

=== Variant B.1.1.207 ===
Varianten sekvenserades först i [[Nigeria]],<ref>{{Webbref|titel=Detection of SARS-CoV-2 P681H Spike Protein Variant in Nigeria|url=https://virological.org/t/detection-of-sars-cov-2-p681h-spike-protein-variant-in-nigeria/567|verk=Virological|datum=2020-12-23|hämtdatum=2021-01-31|språk=en}}</ref> denna varianten har en P681H mutation, vilket även återfinns i Storbritanniens [[Variant B.1.1.7|B.1.1.7]]. Den delar inga andra mutationer med B.1.1.7 och sedan slutet av december 2020 står denna variant för ungefär 1% av alla sekvenserade fall i Nigeria.<ref>{{Webbref|titel=Detection of SARS-CoV-2 P681H Spike Protein Variant in Nigeria|url=https://virological.org/t/detection-of-sars-cov-2-p681h-spike-protein-variant-in-nigeria/567|verk=Virological|datum=2020-12-23|hämtdatum=2021-01-31|språk=en}}</ref> Sedan maj 2021 har varianten upptäckts i 10 länder.<ref>{{Webbref|titel=PANGO lineages|url=https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.1.207.html|verk=cov-lineages.org|hämtdatum=2021-05-17|arkivurl=https://web.archive.org/web/20210127172920/https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.1.207.html|arkivdatum=2021-01-27}}</ref>

=== Variant B.1.620 ===
I mars 2021 upptäcktes denna varianten i [[Litauen]] och döptes därefter till B.1.620. Forskare lyckats identifiera 23 olika mutationer varav 4 är av särskilt intresse. Den bär på en E484K-mutation,<ref>{{Webbref|titel=Unidentified coronavirus strain found in eastern Lithuania|url=https://www.lrt.lt/en/news-in-english/19/1391882/unidentified-coronavirus-strain-found-in-eastern-lithuania|verk=lrt.lt|datum=2021-04-20|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref> D614G<ref>{{Webbref|titel=The travel-related origin and spread of SARS-CoV-2 B.1.620 strain|url=https://www.news-medical.net/news/20210511/The-travel-related-origin-and-spread-of-SARS-CoV-2-B1620-strain.aspx|verk=News-Medical.net|datum=2021-05-11|hämtdatum=2021-06-10|språk=en}}</ref> och P681H samt S477N.<ref>{{Webbref|titel=COVID-19: African variant reveals sequencing lag {{!}} DW {{!}} 19.05.2021|url=https://www.dw.com/en/covid-19-african-variant-reveals-sequencing-lag/a-57586318|verk=DW.COM|hämtdatum=2021-06-10|språk=en-GB|förnamn=Deutsche|efternamn=Welle (www.dw.com)}}</ref>

=== Andra varianter av intresse ===
* Variant B.1.618 – I oktober 2020 isolerades denna varianten för första gången. Den har E484K-mutationen som den sydafrikanska varianten (B.1.351) också har, B.1.618 står för de flesta sekvenserade fallen i [[Västbengalen]].<ref>{{Tidningsref|rubrik=Coronavirus {{!}} New virus lineage found in West Bengal|url=https://www.thehindu.com/sci-tech/health/new-coronavirus-variant-found-in-west-bengal/article34373083.ece|tidning=The Hindu|datum=2021-04-21|hämtdatum=2021-05-17|issn=0971-751X|språk=en-IN|förnamn=Jacob|efternamn=Koshy}}</ref><ref>{{Webbref|titel=What is the new 'triple mutant variant' of Covid-19 virus found in Bengal? How bad is it?|url=https://www.indiatoday.in/amp/science/story/what-is-triple-mutant-variant-of-covid19-virus-bengal-strain-details-1793991-2021-04-22|verk=India Today|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref> Sedan den 23 april 2021 har CoV-Lineages-databasen rapporterat 135 sekvenser identifiera i Indien, med endast en handfull av fall i åtta andra länder.<ref>{{Webbref|titel=PANGO lineages|url=https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.618.html|verk=cov-lineages.org|hämtdatum=2021-05-17|arkivurl=https://web.archive.org/web/20210514093826/https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.618.html|arkivdatum=2021-05-14}}</ref>
* Variant B.1.1.318 – Varianten klassificerades av PHE som en VUI (Variant Under Investigation) - (VUI-21FEB-04,<ref name=":8">{{Webbref|titel=Variants: distribution of cases data|url=https://www.gov.uk/government/publications/covid-19-variants-genomically-confirmed-case-numbers/variants-distribution-of-cases-data|verk=GOV.UK|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref> tidigare VUI-202102/04) den 24 februari 2021. Totalt har 16 fall av varianten upptäckts i Storbritannien.<ref name=":8" /><ref>{{Webbref|titel=Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK|url=https://www.gov.uk/government/news/confirmed-cases-of-covid-19-variants-identified-in-uk|verk=GOV.UK|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref>
* Variant B.1.1.317 – Medan variant B.1.1.317 inte är klassificerad som en [[Variant av särskild betydelse]], Queensland Health tvingade två personer till karantän i [[Brisbane]], [[Australien]] i ytterligare fem dagar mer än de 14 dagar som krävs eftersom de blivit smittade med denna varianten.<ref>{{Webbref|titel=Queensland travellers have hotel quarantine extended after Russian variant of coronavirus detected|url=https://www.abc.net.au/news/2021-03-03/coronavirus-queensland-russian-variant-quarantine/13191524|verk=www.abc.net.au|datum=2021-03-03|hämtdatum=2021-05-17|språk=en-AU}}</ref>
* Den 29 maj 2021 upptäckte forskare i Vietnam en ny, mer smittsam, variant av COVID-19-viruset som kan vara en blandning av varianten först upptäckt i Storbritannien och Indien.<ref>{{Tidningsref|rubrik=Vietnam says it has detected a more contagious hybrid of variants first seen in India and Britain.|url=https://www.nytimes.com/2021/05/29/world/vietnam-new-covid-variant.html|tidning=The New York Times|datum=2021-05-29|hämtdatum=2021-06-10|issn=0362-4331|språk=en-US|förnamn=Elian|efternamn=Peltier|förnamn2=Gina|efternamn2=Kolata}}</ref>

== Överföring mellan arter ==
=== Kluster 5 ===
{{Huvudartikel|Kluster 5}}
I början av november 2019 upptäcktes Kluster 5, också kallad ΔFVI-spike av danska Statens Serum Institut (SSI), i [[Nørrejylland]] i [[Danmark]]. Mutationen tros ha spridits från [[mink]]ar till människor genom minkfarmar. Den 4 november meddelade den danska regeringen att alla minkar i landet skulle avlivas och grävas ner för att förebygga en spridning av denna mutationen och ytterligare mutationer. En nedstängning av flera kommuner infördes i Nørrejylland och den 5 november hade det upptäckts runt 214 mink-relaterade smittofall bland människor.<ref>{{Webbref|url=https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/RRA-SARS-CoV-2-in-mink-12-nov-2020.pdf|titel=Detection of new SARS-CoV-2 variants related to mink|hämtdatum=31 januari 2021|datum=12 november 2020|utgivare=ECDC}}</ref>

SSI varnade att mutationen kunde minska effekten av Covid-19-vaccin som var under utveckling men var inte trolig att göra de värdelösa. Den 19 november 2020 meddelade SSI att kluster 5 med största sannolikhet dött ut.<ref>{{Webbref|titel=De fleste restriktioner lempes i Nordjylland|url=http://sum.dk/nyheder/2020/november/de-fleste-restriktioner-lempes-i-nordjylland|verk=sum.dk|hämtdatum=2021-01-31|språk=da}}</ref>

== Särskilda missense-mutationer ==
=== N440K ===
Denna mutationen har observerats i cellkulturer att vara tio gånger mer smittsam än den tidigare A2a-stammen.<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=N440K variant of SARS-CoV-2 has Higher Infectious Fitness|url=https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.04.30.441434v1|tidskrift=bioRxiv|år=2021-04-30|hämtdatum=2021-05-17|sid=2021.04.30.441434|doi=10.1101/2021.04.30.441434|språk=en|förnamn=Dixit|efternamn=Tandel|förnamn2=Divya|efternamn2=Gupta|förnamn3=Vishal|efternamn3=Sah|förnamn4=Krishnan Harinivas|efternamn4=Harshan}}</ref> Den är delaktig i det snabbt ökande antalet bekräftade fall av Covid-19 i Indien.<ref>{{Tidningsref|rubrik=COVID-19 {{!}} A.P. strain at least 15 times more virulent|url=https://www.thehindu.com/news/national/andhra-pradesh/ap-strain-at-least-15-times-more-virulent/article34474035.ece|tidning=The Hindu|datum=2021-05-03|hämtdatum=2021-05-17|issn=0971-751X|språk=en-IN|förnamn=Sumit|efternamn=Bhattacharjee}}</ref> Indien har den högsta andelen av N440K-muterade varianterna följt av USA och Tyskland.<ref>{{Webbref|titel=Hyderabad: Mutant N440K 10 times more infectious than parent strain - Times of India|url=https://timesofindia.indiatimes.com/city/hyderabad/mutant-n440k-10-times-more-infectious-than-parent-strain/articleshow/82348011.cms|verk=The Times of India|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref>

=== L452R ===
Namnet på mutationen, L452R, hänvisar till ett utbyte där [[leucin]]et (L) är utbytt med [[arginin]] (R) i position 452.<ref>{{Webbref|titel=What Mutations of SARS-CoV-2 are Causing Concern?|url=https://www.news-medical.net/health/What-Mutations-of-SARS-CoV-2-are-Causing-Concern.aspx|verk=News-Medical.net|datum=2021-01-15|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref>

Det har funnits en betydande ökning av bekräftade covid-19 fall i Indien, dels på grund av [[Variant B.1.617|B.1.617]], även, men felaktigt, känd som en "dubbel mutant". L452R är en relevant mutation i denna stam som förstärker ACE2 receptor-bindande funktionen och kan reducera vaccinstimulerade antikroppar från att angripa detta förändrade spikeprotein.

Studier visar att L452R kan göra coronaviruset resistent mot T-celler, som är en klass av celler som är nödvändiga för att identifiera och förstöra virus-smittade celler. Dessa är annorlunda från de antikroppar som är hjälpfulla med att blockera coronavirus-partiklar och förebyggandet av förökning av dessa partiklar inuti kroppen.<ref name="in"/>

=== S477G/N ===
En flexibel region i receptorbindande domänet (Rbd) av SARS-CoV-2, från rest 475 ända upp till rest 485, identifierades med hjälp av [[bioinformatik]] och statistiska metoder i flertal studier.<ref>{{Webbref|titel=Coronavirus SARS-CoV-2 (formerly known as Wuhan coronavirus and 2019-nCoV) – what we can find out on a structural bioinformatics level {{!}} Innophore|url=https://innophore.com/2019-ncov/|hämtdatum=2021-05-17|språk=en-US|efternamn=Innophore}}</ref> Position S477 har den högsta flexibiliteten.<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Serine 477 plays a crucial role in the interaction of the SARS-CoV-2 spike protein with the human receptor ACE2|efternamn=Singh|förnamn5=Christian C.|efternamn4=Gruber|förnamn4=Karl|efternamn3=Köchl|förnamn3=Katharina|efternamn2=Steinkellner|förnamn2=Georg|förnamn=Amit|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7900180/|pmid=33619331|pmc=7900180|doi=10.1038/s41598-021-83761-5|volym=11|issn=2045-2322|hämtdatum=2021-05-17|år=2021-02-22|tidskrift=Scientific Reports|efternamn5=Gruber}}</ref>

=== E484K ===
Namnet på mutationen, E484K, hänvisar till ett utbyte där [[glutaminsyra]] (E) är utbytt med [[lysin]] (K) i position 484.<ref name=":12">{{Webbref|titel=What Mutations of SARS-CoV-2 are Causing Concern?|url=https://www.news-medical.net/health/What-Mutations-of-SARS-CoV-2-are-Causing-Concern.aspx|verk=News-Medical.net|datum=2021-01-15|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref> Den är döpt till "Eeek".<ref name=":14">{{Tidningsref|rubrik=Why Virus Variants Have Such Weird Names|url=https://www.nytimes.com/2021/03/02/health/virus-variant-names.html|tidning=The New York Times|datum=2021-03-02|hämtdatum=2021-05-17|issn=0362-4331|språk=en-US|förnamn=Apoorva|efternamn=Mandavilli|förnamn2=Benjamin|efternamn2=Mueller}}</ref>

Mutationen E484K ser ut att undvika några av de antikroppar i coronavirusets spike-protein, eller ”taggar”, som ett vaccin eller tidigare sjukdom bildar. Därmed kan varianten minska vaccinernas effektivitet.

=== E484Q ===
Namnet på mutationen, E484Q, hänvisar till ett utbyte där [[glutaminsyra]] (E) är utbytt med [[glutamin]] (Q) i position 484.<ref name=":12" />

Indien ser en betyande ökning av bekräftade fall av covid-19 från början av 2021 vilket delvis kan förklaras av [[Variant B.1.617|B.1.617]]. E484Q kan förstärka ACE2 receptorbindande funktionen och vilket kan reducera vaccin-stimulerade antikroppar från att angripa detta förändrade spikeprotein.<ref name="in">{{Tidningsref|rubrik=Coronavirus {{!}} Indian ‘double mutant’ strain named B.1.617|url=https://www.thehindu.com/news/national/indian-double-mutant-strain-named-b1617/article34274663.ece|tidning=The Hindu|datum=2021-04-08|hämtdatum=2021-05-17|issn=0971-751X|språk=en-IN|förnamn=Jacob|efternamn=Koshy}}</ref>

=== N501Y ===
Namnet på mutationen, N501Y, hänvisar till ett utbyte där [[asparagin]]et (N) är utbytt med [[tyrosin]] (Y) i [[Aminosyror|aminosyra]]positionen 501.<ref>{{Webbref|titel=COG-UK update on SARS-CoV-2 Spike mutations of special interest
Report 1|url=https://www.cogconsortium.uk/wp-content/uploads/2020/12/Report-1_COG-UK_20-December-2020_SARS-CoV-2-Mutations_final_updated2.pdf|verk=web.archive.org|datum=2020-12-25|hämtdatum=2021-05-17|utgivare=COG UK|arkivurl=https://web.archive.org/web/20201225050316/https://www.cogconsortium.uk/wp-content/uploads/2020/12/Report-1_COG-UK_20-December-2020_SARS-CoV-2-Mutations_final_updated2.pdf|arkivdatum=2020-12-25}}</ref> N501Y har döpts till "Nelly".<ref name=":14" />

N501Y har några genetiska skillnader i det så kallade spikeproteinet, denna mutation och andra visar att spikeproteinet kan förändras utan att förstöra virusets förmåga att spridas vidare. Mutationen påverkar [[ligand]]en på grund av dess position inuti [[Lipidhölje|lipidhöljets proteiners]] receptor-bindande [[Domän (biologi)|domän]] som behövs för att bindas till [[Angiotensinkonverterande enzym|ACE2]] hos människans celler. Denna mutationen återfinns hos [[Variant P.1]] i Brasilien/Japan,<ref>{{Webbref|titel=Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings|url=https://virological.org/t/genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings/586|verk=Virological|datum=2021-01-12|hämtdatum=2021-01-31|språk=en}}</ref> [[VOC-202012/01|Variant of Concern 202012/01]] i Storbritannien, [[Variant 501.V2]] i Sydfarika och COH.20G/501Y i [[Columbus, Ohio]].<ref>{{Webbref|titel=Researchers Discover New Variant of COVID-19 Virus in Columbus, Ohio|url=https://wexnermedical.osu.edu/mediaroom/pressreleaselisting/new-sars-cov2-variant|verk=wexnermedical.osu.edu|hämtdatum=2021-01-31|språk=en}}</ref>

=== D614G ===
D614G-mutationen förändrade coronavirusets spike-protein, eller ”taggar”, och gjorde att viruset kunde öka sin spridning. Idag är det den vanligaste formen av coronaviruset i Europa.

=== P681H ===
I januari 2021 rapporterade forskare i en [[preprint]] att mutationen 'P681H', har ett karakteristisk särdrag från SARS-CoV-2 varianterna upptäckta i Storbritannien (B.1.1.7) och Nigeria (B.1.1.207), och påvisar en exponentiell ökning i världen, likt 'D614G' som också kan påvisas runt i världen idag.<ref>{{Webbref|titel=Study shows P681H mutation is becoming globally prevalent among SARS-CoV-2 sequences|url=https://www.news-medical.net/news/20210110/Study-shows-P681H-mutation-is-becoming-globally-prevalent-among-SARS-CoV-2-sequences.aspx|verk=News-Medical.net|datum=2021-01-10|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref><ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Genetic Characteristics and Phylogeny of 969-bp S Gene Sequence of SARS-CoV-2 from Hawaii Reveals the Worldwide Emerging P681H Mutation|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7805472/|tidskrift=bioRxiv|år=2021-01-07|hämtdatum=2021-05-17|doi=10.1101/2021.01.06.425497|pmc=7805472|pmid=33442699|förnamn=David P.|efternamn=Maison|förnamn2=Lauren L.|efternamn2=Ching|förnamn3=Cecilia M.|efternamn3=Shikuma|förnamn4=Vivek R.|efternamn4=Nerurkar}}</ref>

=== P681R ===
Namnet på mutationen, P681R, hänvisar till ett utbyte där [[prolin]]et (P) är utbytt med [[arginin]] (R) i position 681.<ref>{{Webbref|titel=What Mutations of SARS-CoV-2 are Causing Concern?|url=https://www.news-medical.net/health/What-Mutations-of-SARS-CoV-2-are-Causing-Concern.aspx|verk=News-Medical.net|datum=2021-01-15|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref>

Indiska SARS-CoV-2 Genomics Consortium (INSACOG) har upptäckt att utöver de två mutationerna E484Q och L452R finns det en tredje signifikant mutation, P681R i B.1.617. Alla tre mutationerna är på spikeproteinet, den delen av coronaviruset som binder sig fast på receptor-bindande cellerna i kroppen.<ref name="in"/>

=== A701V ===
Enligt lokala rapporter från [[Malaysia]]s hälsomyndighet, den 23 december 2020 upptäcktes en mutation i SARS-CoV-2 genomet som de döpte till A701B(sic). Mutationen rapporterades vara lik mutationerna som hittats i Sydafrika, Australien och Nederländerna, dock var det oklart om denna mutationen var mer smittsam eller aggressiv än tidigare.<ref>{{Webbref|titel=Malaysia identifies new Covid-19 strain, similar to one found in 3 other countries|url=https://www.straitstimes.com/asia/se-asia/malaysia-has-identified-new-covid-19-strain-similar-to-one-found-in-3-other-nations|verk=The Straits Times|datum=2020-12-23|hämtdatum=2021-05-17|språk=en|efternamn=hermesauto}}</ref>

A701V-mutationen har [[Aminosyror|aminosyran]] [[alanin]] som är [[Mutation#Substitution|substituerad]] med [[valin]] i position 701 i spikeproteinet. Globalt har Sydafrika, Australien, Nederländerna och England också rapporterat A701V runt samma tidpunkt som Malaysia.<ref name=":13">{{Webbref|titel=COVID-19 Malaysia Updates|url=http://covid-19.moh.gov.my/|verk=COVID-19 Malaysia|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref> I [[GISAID]] förekommer denna mutationen i ca. 0,18% av alla fall.<ref name=":13" />

Den 14 april 2021 rapporterade "Kementerian Kesihatan Malaysia" att den tredje vågen, som startat i [[Sabah]], introducerade varainter med D614G- och A701V-mutationer.<ref name=":13"/>

=== N439K ===
Mutationen upptäcktes för första gången under våren 2020 i [[Skottland]] där den tros ha sitt ursprung.<ref>{{Webbref|titel=Hunt on for future Covid mutations that cause treatments to lose potency|url=http://www.theguardian.com/world/2020/oct/20/scientists-on-lookout-for-covid-mutations-which-cause-treatments-to-lose-potency|verk=the Guardian|datum=2020-10-20|hämtdatum=2020-12-23|språk=en}}</ref> Forskare tror att denna mutationen kan vara mer smittsam än den variant som först upptäcktes i [[Wuhan]], [[Kina]].<ref>{{Webbref|titel=N439K mutation of SARS-CoV-2 may be more infectious and antibody resistant than Wuhan strain|url=https://www.news-medical.net/news/20201127/N439K-mutation-of-SARS-CoV-2-may-be-more-infectious-and-antibody-resistant-than-Wuhan-strain.aspx|verk=News-Medical.net|datum=2020-11-27|hämtdatum=2020-12-23|språk=en}}</ref> Forskare tror även att denna variant kan leda till att de vaccin som tagits fram kan ha en försämrad effekt.<ref>{{Webbref|titel=N439K mutation of SARS-CoV-2 may be more infectious and antibody resistant than Wuhan strain|url=https://www.news-medical.net/news/20201127/N439K-mutation-of-SARS-CoV-2-may-be-more-infectious-and-antibody-resistant-than-Wuhan-strain.aspx|verk=News-Medical.net|datum=2020-11-27|hämtdatum=2020-12-23|språk=en}}</ref><ref>{{Tidningsref|rubrik=Ny virusmutation oroar i Danmark|url=https://www.svt.se/nyheter/lokalt/skane/ny-virusmutation-oroar-i-danmark|tidning=SVT Nyheter|datum=2020-12-22|hämtdatum=2020-12-23|språk=sv|efternamn=TT}}</ref><ref>{{Webbref|titel=Coronavirus strain that can be less susceptible to vaccine found in Denmark — agency|url=https://tass.com/world/1238695|verk=TASS|hämtdatum=2020-12-23}}</ref><ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Escape from neutralizing antibodies by SARS-CoV-2 spike protein variants|förnamn2=Fabian|förnamn6=Julio C. C.|efternamn5=Poston|förnamn5=Daniel|efternamn4=DaSilva|förnamn4=Justin|efternamn3=Zhang|förnamn3=Fengwen|efternamn2=Schmidt|efternamn=Weisblum|url=https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.07.21.214759v1|förnamn=Yiska|språk=en|doi=10.1101/2020.07.21.214759|sid=2020.07.21.214759|hämtdatum=2020-12-23|år=2020-07-22|tidskrift=bioRxiv|efternamn6=Lorenzi}}</ref> Denna mutation och andra visar att spikeproteinet kan förändras utan att förstöra virusets förmåga att spridas vidare. Forskare har också sedan tidigare visat att denna mutation är åtminstone immun mot en slags antikropp som smittade människor kan producera.<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=The Impact of Mutations in SARS-CoV-2 Spike on Viral Infectivity and Antigenicity|förnamn=Qianqian|förnamn6=Shuo|efternamn5=Hao|förnamn5=Huan|efternamn4=Zhang|förnamn4=Li|efternamn3=Nie|förnamn3=Jianhui|efternamn2=Wu|förnamn2=Jiajing|efternamn=Li|språk=English|url=https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(20)30877-1|pmid=32730807|doi=10.1016/j.cell.2020.07.012|nummer=5|volym=182|sid=1284–1294.e9|issn=0092-8674|hämtdatum=2020-12-23|år=2020-09-03|tidskrift=Cell|efternamn6=Liu}}</ref>

== Nya varianter av särskilt intresse ==
Den 29 maj 2021 upptäckte forskare i Vietnam en ny, mer smittsam variant av Covid-19-viruset som kan vara en blandning av varianterna först upptäckta i Indien och Storbritannien.<ref>{{Tidningsref|rubrik=Vietnam says it has detected a more contagious hybrid of variants first seen in India and Britain.|url=https://www.nytimes.com/2021/05/29/world/vietnam-new-covid-variant.html|tidning=The New York Times|datum=2021-05-29|hämtdatum=2021-06-06|issn=0362-4331|språk=en-US|förnamn=Elian|efternamn=Peltier|förnamn2=Gina|efternamn2=Kolata}}</ref>

== Ursprung av varianter ==
Forskare har antytt att flera mutationer kan få sitt ursprung hos patienter som lider av [[Immunsuppression|immunsuppresion]] under en pågående infektion av covid-19.<ref>{{Webbref|titel=U.K. variant puts spotlight on immunocompromised patients’ role in the COVID-19 pandemic|url=https://www.sciencemag.org/news/2020/12/uk-variant-puts-spotlight-immunocompromised-patients-role-covid-19-pandemic|verk=Science {{!}} AAAS|datum=2020-12-23|hämtdatum=2021-05-17|språk=en|förnamn=Kai|efternamn=KupferschmidtDec. 23|efternamn2=2020|förnamn3=2:30|efternamn3=Pm}}</ref><ref>{{Webbref|titel=COVID Variants May Arise in People with Compromised Immune Systems|url=https://www.scientificamerican.com/article/covid-variants-may-arise-in-people-with-compromised-immune-systems/|verk=Scientific American|hämtdatum=2021-05-17|språk=en|förnamn=Stephani|efternamn=Sutherland}}</ref><ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Recurrent deletions in the SARS-CoV-2 spike glycoprotein drive antibody escape|efternamn=McCarthy|förnamn6=Ghady|efternamn5=Bain|förnamn5=William G.|efternamn4=Robinson-McCarthy|förnamn4=Lindsey R.|efternamn3=Nambulli|förnamn3=Sham|efternamn2=Rennick|förnamn2=Linda J.|förnamn=Kevin R.|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7971772/|pmid=33536258|pmc=7971772|doi=10.1126/science.abf6950|nummer=6534|volym=371|sid=1139–1142|issn=0036-8075|hämtdatum=2021-05-17|år=2021-03-12|tidskrift=Science (New York, N.y.)|efternamn6=Haidar}}</ref>

== Se även ==
* [[RaTG13]], den närmsta släktingen till SARS-CoV-2

== Referenser ==
<references />

== Externa länkar ==
{{Coronavirus}}

[[Kategori:Covid-19-pandemin]]
[[Kategori:Pågående epidemier]]
[[Kategori:Varianter av SARS-CoV-2| ]]