Varianter av sars-cov-2: Skillnad mellan sidversioner

Från Wikipedia
Bläddra interaktivt i historiken
← Äldre redigeringNyare redigering →
Innehåll som raderades Innehåll som lades till
VisuellWikitext
Fix död länk
Uppdaterat med aktuell information
Rad 3: Rad 3:
[[Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]] (SARS-CoV-2), viruset som orsakar [[Covid-19]], has många olika varianter; vissa är eller tros varit av särskild betydelse. Denna artikeln diskuterar '''varianter av SARS-CoV-2 som har särskild betydelse'''.
[[Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]] (SARS-CoV-2), viruset som orsakar [[Covid-19]], has många olika varianter; vissa är eller tros varit av särskild betydelse. Denna artikeln diskuterar '''varianter av SARS-CoV-2 som har särskild betydelse'''.


Sekvensen ''WIV04/2019'', som tillhör [[GISAID]] S [[Kladistik|kladen]] / [[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|PANGOLIN]] A kladen / [[Nextstrain]] 19B kladen, som tros vara den originella sekvensen som smittar människor, känd som "sekvens noll" (sequence zero).<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Origin, evolution and global spread of SARS-CoV-2|url=https://comptes-rendus.academie-sciences.fr/biologies/item/CRBIOL_0__0_0_A1_0/|tidskrift=Comptes Rendus. Biologies|år=0|hämtdatum=2021-01-31|sid=1–19|volym=0|nummer=0|doi=10.5802/crbiol.29|förnamn=Anna|efternamn=Zhukova|förnamn2=Luc|efternamn2=Blassel|förnamn3=Frédéric|efternamn3=Lemoine|förnamn4=Marie|efternamn4=Morel|förnamn5=Jakub|efternamn5=Voznica|förnamn6=Olivier|efternamn6=Gascuel}}</ref> Sekvensen ''WIV04/2019'' sekvenserades från en symptomatisk patient den 30 december 2019 och är en referenssekvens.<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Origin, evolution and global spread of SARS-CoV-2|förnamn2=Luc|förnamn6=Olivier|efternamn5=Voznica|förnamn5=Jakub|efternamn4=Morel|förnamn4=Marie|efternamn3=Lemoine|förnamn3=Frédéric|efternamn2=Blassel|efternamn=Zhukova|url=https://comptes-rendus.academie-sciences.fr/biologies/item/CRBIOL_0__0_0_A1_0/|förnamn=Anna|doi=10.5802/crbiol.29|nummer=0|volym=0|sid=1–19|hämtdatum=2021-05-17|år=0|tidskrift=Comptes Rendus. Biologies|efternamn6=Gascuel}}</ref> Dock refererar en annan grupp (Sudhir Kumar m.fl.),<ref name=":4">{{Webbref|url=https://academic.oup.com/mbe/advance-article/doi/10.1093/molbev/msab118/6257226|titel=An evolutionary portrait of the progenitor SARS-CoV-2 and its dominant offshoots in COVID-19 pandemic|hämtdatum=17 maj 2021|datum=4 maj 2021|utgivare=Molecular Biology and Evolution|författare=Sudhir Kumar et al.}}</ref> till [[National Center for Biotechnology Information|NCBI]] referensgenomet (GenBankID:NC_045512; GISAID ID: EPI_ISL_402125),<ref>{{Webbref|url=https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32015508/|titel=A new coronavirus associated with human respiratory disease in China|hämtdatum=17 maj 2021|datum=3 februari 2020|utgivare=NIH, National Library of Medicine|författare=Fan Wu, Su Zhao, Bin Yu, Yan-Mei Chen, Wen Wang, Zhi-Gang Song, Yi Hu, Zhao-Wu Tao, Jun-Hua Tian, Yuan-Yuan Pei, Ming-Li Yuan, Yu-Ling Zhang, Fa-Hui Dai, Yi Liu, Qi-Min Wang, Jiao-Jiao Zheng, Lin Xu, Edward C Holmes, Yong-Zhen Zhang}}</ref> denna sekvens samlades in den 26 december 2019,<ref>{{Webbref|url=https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33605421/|titel=Comparative genomics reveals early emergence and biased spatio-temporal distribution of SARS-CoV-2|hämtdatum=17 maj 2021|datum=19 februari 2021|utgivare=NIH, National Library of Medicine|författare=Matteo Chiara, David S Horner, Carmela Gissi, Graziano Pesole}}</ref> dock använde denna gruppen också ''WIV04'' GISAID referensgenomet med (ID: EPI_ISL_402124)<ref>{{Webbref|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7095418|titel=A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin|hämtdatum=17 maj 2021|datum=3 februari 2020|utgivare=Nature, PMC|författare=Zhengli, Shi et al.}}</ref> i sin analys.<ref>{{Webbref|url=https://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.8.2000097|titel=Early transmission patterns of coronavirus disease 2019 (COVID-19) in travellers from Wuhan to Thailand, January 2020|hämtdatum=17 maj 2021|datum=februari 2020|utgivare=Euro Surveill.|författare=Okada Pilailuk, Buathong Rome, Phuygun Siripaporn, Thanadachakul Thanutsapa, Parnmen Sittiporn, Wongboot Warawan, Waicharoen Sunthareeya, Wacharapluesadee Supaporn, Uttayamakul Sumonmal, Vachiraphan Apichart, Chittaganpitch Malinee, Mekha Nanthawan, Janejai Noppavan, Iamsirithaworn Sopon, Lee Raphael TC, Maurer-Stroh Sebastian.}}</ref> Den äldsta sekvensen, ''Wuhan-1'', samlades in den 24 december 2019.<ref name=":4" />
Sekvensen ''WIV04/2019'', som tillhör [[GISAID]] S [[Kladistik|kladen]] / [[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|PANGOLIN]] A kladen, som tros vara den originella sekvensen som smittar människor, känd som "sekvens noll" (sequence zero).<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Origin, evolution and global spread of SARS-CoV-2|url=https://comptes-rendus.academie-sciences.fr/biologies/item/CRBIOL_0__0_0_A1_0/|tidskrift=Comptes Rendus. Biologies|år=0|hämtdatum=2021-01-31|sid=1–19|volym=0|nummer=0|doi=10.5802/crbiol.29|förnamn=Anna|efternamn=Zhukova|förnamn2=Luc|efternamn2=Blassel|förnamn3=Frédéric|efternamn3=Lemoine|förnamn4=Marie|efternamn4=Morel|förnamn5=Jakub|efternamn5=Voznica|förnamn6=Olivier|efternamn6=Gascuel}}</ref>


== Sammanfattning ==
== Sammanfattning ==
Rad 9: Rad 9:
|+
|+
! colspan="2" |Upptäcktes
! colspan="2" |Upptäcktes
⚫
! rowspan="2" |Spridning
⚫
! rowspan="2" |[[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|PANGOLIN]] variant<ref>{{Webbref|titel=PANGO lineages|url=https://cov-lineages.org/lineages.html|verk=cov-lineages.org|hämtdatum=2021-03-21}}</ref>
! colspan="4" |Identifikation
⚫
! rowspan="2" |Nextstrain<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution|förnamn2=Colin|förnamn6=Charlton|efternamn5=Potter|förnamn5=Barney|efternamn4=Huddleston|förnamn4=John|efternamn3=Bell|förnamn3=Sidney M|efternamn2=Megill|efternamn=Hadfield|url=https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty407|förnamn=James|doi=10.1093/bioinformatics/bty407|nummer=23|volym=34|sid=4121–4123|issn=1367-4803|hämtdatum=2021-03-21|år=2018-12-01|tidskrift=Bioinformatics|efternamn6=Callender}}</ref> [[klad]]<ref>{{Webbref|titel=Nextstrain|url=https://nextstrain.org/|verk=nextstrain.org|hämtdatum=2021-03-21|språk=en}}</ref>
⚫
! rowspan="2" |[[Public Health England|PHE]] Variant<ref>{{Webbref|titel=Variants: distribution of cases data|url=https://www.gov.uk/government/publications/covid-19-variants-genomically-confirmed-case-numbers/variants-distribution-of-cases-data|verk=GOV.UK|hämtdatum=2021-03-21|språk=en}}</ref>
! rowspan="2" |Andra namn
! rowspan="2" |Särskilda mutationer
! rowspan="2" |Särskilda mutationer
! colspan="3" |Bevis på kliniska förändringar
! colspan="3" |Bevis på kliniska förändringar
⚫
! rowspan="2" |Spridning
|-
|-
!Land
!Land
!Datum
!Datum
⚫
![[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|PANGOLIN]] variant<ref name=":5">{{Webbref|titel=PANGO lineages|url=https://cov-lineages.org/lineages.html|verk=cov-lineages.org|hämtdatum=2021-03-21}}</ref>
⚫
!Nextstrain<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution|förnamn=James|tidskrift=Bioinformatics|år=2018-12-01|hämtdatum=2021-03-21|issn=1367-4803|sid=4121–4123|volym=34|nummer=23|doi=10.1093/bioinformatics/bty407|url=https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty407|förnamn2=Colin|efternamn=Hadfield|efternamn2=Megill|förnamn3=Sidney M|efternamn3=Bell|förnamn4=John|efternamn4=Huddleston|förnamn5=Barney|efternamn5=Potter|förnamn6=Charlton|efternamn6=Callender}}</ref> [[klad]]<ref>{{Webbref|titel=Nextstrain|url=https://nextstrain.org/|verk=nextstrain.org|hämtdatum=2021-03-21|språk=en}}</ref>
⚫
![[Public Health England|PHE]] Variant<ref>{{Webbref|titel=Variants: distribution of cases data|url=https://www.gov.uk/government/publications/covid-19-variants-genomically-confirmed-case-numbers/variants-distribution-of-cases-data|verk=GOV.UK|hämtdatum=2021-03-21|språk=en}}</ref>
⚫
!Andra namn
![[Smitta|Smittsamhet]]
![[Smitta|Smittsamhet]]
![[Virulens]]
![[Virulens]]
![[Vaccinimmunogenitet]]
![[Vaccinimmunogenitet]]
⚫
|-
⚫
|{{Flaggbild|Nigeria}} [[Nigeria]]
|augusti 2020
⚫
|B.1.1.207
⚫
|―
⚫
|―
⚫
|<div style="text-align: center;">―</div>
⚫
|P681H<ref>{{Webbref|titel=Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-01-31|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref>
⚫
| style="background:#eeeeee" |―
⚫
| style="background:#eeeeee" |―
⚫
| style="background:#eeeeee" |―
⚫
| style="background:#FFFF00" |Internationell spridning
|-
|-
|{{Flaggbild|Storbritannien}} [[Storbritannien]]
|{{Flaggbild|Storbritannien}} [[Storbritannien]]
|februari 2020<ref name=":5" />
|september 2020
⚫
| style="background:#ffcc88" |Global spridning
|[[Variant B.1.1.7|B.1.1.7]]
|[[Variant B.1.1.7|B.1.1.7]]
|20B/501Y.V1
|20B/501Y.V1
Rad 47: Rad 37:
B.1.1.7 in England: Insights from linking
B.1.1.7 in England: Insights from linking
epidemiological and genetic data|hämtdatum=21 mars 2021|utgivare=Imperial UK}}</ref>
epidemiological and genetic data|hämtdatum=21 mars 2021|utgivare=Imperial UK}}</ref>
| style="background:#ffcc88" |≈64% {{Abbr|(32–104%)|95% säkerhetsintervall}} mer dödlig<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Risk of mortality in patients infected with SARS-CoV-2 variant of concern 202012/1: matched cohort study|efternamn=Challen|förnamn6=Leon|efternamn5=Tsaneva-Atanasova|förnamn5=Krasimira|efternamn4=Dyson|förnamn4=Louise|efternamn3=Read|förnamn3=Jonathan M.|efternamn2=Brooks-Pollock|förnamn2=Ellen|förnamn=Robert|url=https://www.bmj.com/content/372/bmj.n579|språk=en|pmid=33687922|doi=10.1136/bmj.n579|volym=372|sid=n579|issn=1756-1833|hämtdatum=2021-03-21|år=2021-03-10|tidskrift=BMJ|efternamn6=Danon}}</ref>
| style="background:#ffcc88" |≈61% {{Abbr|(42–82%)|95% säkerhetsintervall}} mer dödlig<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Risk of mortality in patients infected with SARS-CoV-2 variant of concern 202012/1: matched cohort study|efternamn=Challen|förnamn6=Leon|efternamn5=Tsaneva-Atanasova|förnamn5=Krasimira|efternamn4=Dyson|förnamn4=Louise|efternamn3=Read|förnamn3=Jonathan M.|efternamn2=Brooks-Pollock|förnamn2=Ellen|förnamn=Robert|url=https://www.bmj.com/content/372/bmj.n579|språk=en|pmid=33687922|doi=10.1136/bmj.n579|volym=372|sid=n579|issn=1756-1833|hämtdatum=2021-03-21|år=2021-03-10|tidskrift=BMJ|efternamn6=Danon}}</ref>
| style="background:#ccffcc" |Ingen förändring<ref>{{Webbref|titel=Risk Assessment: Risk related to the spread of new SARS-CoV-2 variants of concern in the EU/EEA – first update|url=https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/covid-19-risk-assessment-spread-new-variants-concern-eueea-first-update|verk=European Centre for Disease Prevention and Control|datum=2021-01-21|hämtdatum=2021-04-18|språk=en}}</ref>
| style="background:#ccffcc" |Ingen förändring<ref>{{Webbref|titel=Risk Assessment: Risk related to the spread of new SARS-CoV-2 variants of concern in the EU/EEA – first update|url=https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/covid-19-risk-assessment-spread-new-variants-concern-eueea-first-update|verk=European Centre for Disease Prevention and Control|datum=2021-01-21|hämtdatum=2021-04-18|språk=en}}</ref>
([[ECDC]])
([[ECDC]])
⚫
|-
⚫
|{{Flaggbild|Nigeria}} [[Nigeria]]
|augusti 2020<ref>{{Webbref|titel=PANGO lineages|url=https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.1.207.html|verk=cov-lineages.org|hämtdatum=2021-05-17}}</ref>
| style="background:#ffcc88" |Global spridning
| style="background:#ffcc88" |Global spridning
⚫
|B.1.1.207
⚫
|―
⚫
|―
⚫
|<div style="text-align: center;">―</div>
⚫
|P681H<ref>{{Webbref|titel=Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-01-31|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref>
⚫
| style="background:#ccffcc" |Inget bevis på förändring
⚫
| style="background:#ccffcc" |Inget bevis på förändring
⚫
| style="background:#eeeeee" |Under utredning
|-
|-
|{{Flaggbild|USA}} [[USA]]
|{{Flaggbild|USA}} [[USA]]
|juni 2020<ref name=":1">{{Webbref|titel=PANGO lineages|url=https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.429.html|verk=cov-lineages.org|hämtdatum=2021-03-21}}</ref>
|juni 2020<ref name=":1">{{Webbref|titel=PANGO lineages|url=https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.429.html|verk=cov-lineages.org|hämtdatum=2021-03-21}}</ref>
⚫
| style="background:#ffcc88" |Global spridning
|B.1.429, B.1.427<ref name=":1" />
|B.1.429, B.1.427<ref name=":1" />
|20C/S:452R
|20C/S:452R
Rad 59: Rad 61:
|CAL.20C<ref>{{Webbref|titel=Southern California COVID-19 Strain Expands Global Reach|url=https://www.cedars-sinai.org/newsroom/southern-california-covid-19-strain-rapidly-expands-global-reach/|verk=Southern California COVID-19 Strain Expands Global Reach|hämtdatum=2021-04-18|språk=en-us}}</ref>
|CAL.20C<ref>{{Webbref|titel=Southern California COVID-19 Strain Expands Global Reach|url=https://www.cedars-sinai.org/newsroom/southern-california-covid-19-strain-rapidly-expands-global-reach/|verk=Southern California COVID-19 Strain Expands Global Reach|hämtdatum=2021-04-18|språk=en-us}}</ref>
|I4205V, D1183Y, S13I, W152C, L452R
|I4205V, D1183Y, S13I, W152C, L452R
| style="background:#FFFF00" |≈20% mer smittsam<ref>{{Webbref|titel=Cases, Data, and Surveillance|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/variant-surveillance/variant-info.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-03-21|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref>
| style="background:#FFFF00" |≈20% {{Abbr|(18,6–24,2%)|95% säkerhetsintervall}} mer smittsam<ref>{{Webbref|titel=Cases, Data, and Surveillance|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/variant-surveillance/variant-info.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-03-21|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref>
| style="background:#eeeeee" |Under utredning
| style="background:#eeeeee" |Under utredning
| style="background:#ffaaaa" |Måttligt minskad neutralisering<ref>{{Webbref|titel=California coronavirus strain may be more infectious—and lethal|url=https://www.sciencemag.org/news/2021/02/coronavirus-strain-first-identified-california-may-be-more-infectious-and-cause-more|verk=Science {{!}} AAAS|datum=2021-02-23|hämtdatum=2021-03-21|språk=en|förnamn=Meredith|efternamn=WadmanFeb. 23|efternamn2=2021|förnamn3=1:20|efternamn3=Pm}}</ref>
| style="background:#ffcc88" |Måttligt minskad känslighet för neutraliserande antikroppar<ref>{{Webbref|titel=California coronavirus strain may be more infectious—and lethal|url=https://www.sciencemag.org/news/2021/02/coronavirus-strain-first-identified-california-may-be-more-infectious-and-cause-more|verk=Science {{!}} AAAS|datum=2021-02-23|hämtdatum=2021-05-17|språk=en|förnamn=Meredith|efternamn=WadmanFeb. 23|efternamn2=2021|förnamn3=1:20|efternamn3=Pm}}</ref>
⚫
| style="background:#ffcc88" |Global spridning
|-
|-
|{{Flaggbild|Danmark}} [[Danmark]]
|{{Flaggbild|Danmark}} [[Danmark]]
|september 2020<ref>{{Webbref|titel=WHO {{!}} SARS-CoV-2 mink-associated variant strain – Denmark|url=http://www.who.int/csr/don/06-november-2020-mink-associated-sars-cov2-denmark/en/|verk=WHO|hämtdatum=2021-05-17}}</ref>
|oktober 2020
⚫
| colspan="3" style="background:#eeeeee" |<div style="text-align: center;">―</div>
⚫
|[[Kluster 5]], ΔFVI-spike (SSI)<ref>{{Webbref|url=https://files.ssi.dk/Mink-cluster-5-short-report_AFO2|titel=Working paper on SARS-CoV-2 spike mutations arising in Danish mink, their 2 spread to humans and neutralization data.|hämtdatum=31 januari 2021|datum=11 november 2020|utgivare=SSI}}</ref>
⚫
|Y453F, 69–70deltaHV
⚫
| style="background:#eeeeee" |―
⚫
| style="background:#eeeeee" |―
| style="background:#ffcc88" |Måttligt minskad känslighet för neutraliserande antikroppar ([[Världshälsoorganisationen|WHO]])
| style="background:#00FFFF" |Tros vara utrotad
| style="background:#00FFFF" |Tros vara utrotad
⚫
| colspan="3" style="background:#eeeeee" |<div style="text-align: center;">―{{Anm|"—" betyder att det inte finns någon pålitlig källa att citera.}}</div>
⚫
|[[Kluster 5]], ΔFVI-spike (SSI)<ref name=":7">{{Webbref|url=https://files.ssi.dk/Mink-cluster-5-short-report_AFO2|titel=Working paper on SARS-CoV-2 spike mutations arising in Danish mink, their 2 spread to humans and neutralization data.|hämtdatum=31 januari 2021|datum=11 november 2020|utgivare=SSI}}</ref>
⚫
|Y453F, 69–70deltaHV<ref name=":7" />
⚫
| colspan="2" style="background:#eeeeee" |―
| style="background:#ffcc88" |Måttligt minskad känslighet för neutraliserande antikroppar<ref>{{Webbref|titel=WHO {{!}} SARS-CoV-2 mink-associated variant strain – Denmark|url=http://www.who.int/csr/don/06-november-2020-mink-associated-sars-cov2-denmark/en/|verk=WHO|hämtdatum=2021-05-17}}</ref>
|-
|-
|{{Flaggbild|Sydafrika}} [[Sydafrika]]
|{{Flaggbild|Sydafrika}} [[Sydafrika]]
|oktober 2020<ref>{{Webbref|titel=Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/science/science-briefs/scientific-brief-emerging-variants.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-05-17|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref>
|december 2020
⚫
| style="background:#ffcc88" |Global spridning
|[[Variant 501.V2|B.1.351]]<ref>{{Webbref|titel=Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-03-21|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref>
|[[Variant 501.V2|B.1.351]]<ref>{{Webbref|titel=Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-03-21|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref>
|20H/501Y.V2<ref>{{Webbref|titel=Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-03-21|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref>
|20H/501Y.V2<ref>{{Webbref|titel=Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-03-21|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref>
|<abbr>VOC</abbr>-202012/02
|<abbr>VOC</abbr>-202012/02
|501Y.V2<ref>{{Webbref|titel=Risk Assessment: Risk related to the spread of new SARS-CoV-2 variants of concern in the EU/EEA – first update|url=https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/covid-19-risk-assessment-spread-new-variants-concern-eueea-first-update|verk=European Centre for Disease Prevention and Control|datum=2021-01-21|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref>
|501Y.V2
|N501Y, K417N, E484K<ref name=":0" />
|N501Y, K417N, E484K<ref name=":0" />
| style="background:#ffcc88" |≈50% {{Abbr|(20–113%)|95% säkerhetsintervall}} mer smittsam<ref name=":2">{{Webbref|url=https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/COVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEA-first-update.pdf|titel=Risk related to the spread of new
| style="background:#ffcc88" |≈50% {{Abbr|(20–113%)|95% säkerhetsintervall}} mer smittsam<ref name=":2">{{Webbref|url=https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/COVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEA-first-update.pdf|titel=Risk related to the spread of new
SARS-CoV-2 variants of concern
SARS-CoV-2 variants of concern
in the EU/EEA – first update|hämtdatum=21 mars 2021|datum=21 januari 2021|utgivare=ECDC}}</ref>
in the EU/EEA – first update|hämtdatum=21 mars 2021|datum=21 januari 2021|utgivare=ECDC}}</ref>
| style="background:#eeeeee" |―
| style="background:#ccffcc" |Inget bevis på förändring
| style="background:#ffaaaa" |Signifikant reduktion i neutralisering av antikroppar<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Sensitivity of infectious SARS-CoV-2 B.1.1.7 and B.1.351 variants to neutralizing antibodies|efternamn=Planas|förnamn6=Françoise|efternamn5=Staropoli|förnamn5=Isabelle|efternamn4=Guivel-Benhassine|förnamn4=Florence|efternamn3=Grzelak|förnamn3=Ludivine|efternamn2=Bruel|förnamn2=Timothée|förnamn=Delphine|url=https://www.nature.com/articles/s41591-021-01318-5|språk=en|doi=10.1038/s41591-021-01318-5|nummer=5|volym=27|sid=917–924|issn=1546-170X|hämtdatum=2021-05-17|år=2021-05|tidskrift=Nature Medicine|efternamn6=Porrot}}</ref><ref>{{Webbref|titel=Sinovac Covid-19 vaccine offers less protection against South African strain|url=https://www.scmp.com/news/hong-kong/health-environment/article/3130355/coronavirus-sinovac-vaccine-gives-70-cent-less|verk=South China Morning Post|datum=2021-04-20|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref>
| style="background:#ffaaaa" |21% minskning av vaccinimmunogenitet, men effektiv neutralisering ([[ECDC]])
⚫
| style="background:#ffcc88" |Global spridning
|-
|-
|{{Flaggbild|Indien}} [[Indien]]
|{{Flaggbild|Indien}} [[Indien]]
|oktober 2020<ref>{{Webbref|titel=PANGO lineages|url=https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.617.html|verk=cov-lineages.org|hämtdatum=2021-05-17}}</ref>
|oktober 2020
⚫
| style="background:#ffcc88" |Global spridning
|B.1.617
|B.1.617
|―
|―
Rad 95: Rad 96:
|
|
|E484Q, L452R, P681R<ref>{{Tidningsref|rubrik=Arrival of India’s ‘double mutation’ adds to variant woes, but threat posed remains unclear|url=https://www.telegraph.co.uk/global-health/science-and-disease/arrival-indias-double-mutation-adds-variant-woes-threat-posed/|tidning=The Telegraph|datum=2021-04-16|hämtdatum=2021-04-18|issn=0307-1235|språk=en-GB|förnamn=Paul|efternamn=Nuki|förnamn2=Sarah|efternamn2=Newey}}</ref>
|E484Q, L452R, P681R<ref>{{Tidningsref|rubrik=Arrival of India’s ‘double mutation’ adds to variant woes, but threat posed remains unclear|url=https://www.telegraph.co.uk/global-health/science-and-disease/arrival-indias-double-mutation-adds-variant-woes-threat-posed/|tidning=The Telegraph|datum=2021-04-16|hämtdatum=2021-04-18|issn=0307-1235|språk=en-GB|förnamn=Paul|efternamn=Nuki|förnamn2=Sarah|efternamn2=Newey}}</ref>
| style="background:#ffaaaa" |Potentiellt ≈120% högre smittsamhet
| style="background:#eeeeee" |Under utredning
| style="background:#eeeeee" |Under utredning
| style="background:#FFFF00" |Potentiell minskad neutralisering av antikroppar<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Neutralization of variant under investigation B.1.617 with sera of BBV152 vaccinees|efternamn2=Sapkal|förnamn6=Deepak Y.|efternamn5=Deshpande|förnamn5=Gururaj|efternamn4=Ella|förnamn4=Raches|efternamn3=Abraham|förnamn3=Priya|förnamn2=Gajanan N.|url=https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.04.23.441101v1|efternamn=Yadav|förnamn=Pragya D.|språk=en|doi=10.1101/2021.04.23.441101|sid=2021.04.23.441101|hämtdatum=2021-05-17|år=2021-04-23|tidskrift=bioRxiv|efternamn6=Patil}}</ref>
⚫
| style="background:#eeeeee" |Under utredning
⚫
| style="background:#eeeeee" |Under utredning
⚫
| style="background:#ffcc88" |Global spridning
|-
|-
|{{Flaggbild|Japan}} [[Japan]]
|{{Flaggbild|Japan}} [[Japan]]
{{Flaggbild|Brasilien}} [[Brasilien]]
{{Flaggbild|Brasilien}} [[Brasilien]]
|december 2020<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=New mutations raise specter of ‘immune escape’|url=https://science.sciencemag.org/content/371/6527/329|tidskrift=Science|år=2021-01-22|hämtdatum=2021-05-17|issn=0036-8075|sid=329–330|volym=371|nummer=6527|doi=10.1126/science.371.6527.329|pmid=33479129|språk=en|förnamn=Kai|efternamn=Kupferschmidt}}</ref>
|januari 2021
⚫
| style="background:#ffcc88" |Global spridning
|[[Variant P.1|P.1]]<ref name=":2" />
|[[Variant P.1|P.1]]<ref name=":2" />
|20J/501Y.V3<ref>{{Webbref|titel=Cases, Data, and Surveillance|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/variant-surveillance/variant-info.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-03-21|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref>
|20J/501Y.V3<ref>{{Webbref|titel=Cases, Data, and Surveillance|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/variant-surveillance/variant-info.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-03-21|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref>
|<abbr>VOC</abbr>-202101/02
|<abbr>VOC</abbr>-202101/02
|Koppling till B.1.1.28<ref>{{Webbref|titel=Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings|url=https://virological.org/t/genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings/586|verk=Virological|datum=2021-01-12|hämtdatum=2021-03-21|språk=en}}</ref>
|B.1.1.28.1<ref>{{Webbref|titel=Lineage P.1|url=https://cov-lineages.org/global_report_P.1.html|verk=cov-lineages.org|hämtdatum=2021-05-17}}</ref><ref>{{Webbref|titel=Living Evidence - SARS-CoV-2 variants|url=https://aci.health.nsw.gov.au/covid-19/critical-intelligence-unit/sars-cov-2-variants|verk=Agency for Clinical Innovation|datum=2021-05-13|hämtdatum=2021-05-17|språk=en|förnamn=Agency for Clinical|efternamn=Innovation}}</ref>
|N501Y, E484K<ref name=":0" />
|N501Y, E484K<ref name=":0" />
| style="background:#ffaaaa" |≈152% {{Abbr|(127–178%)|95% säkerhetsintervall}} mer smittsam<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Model-based evaluation of transmissibility and reinfection for the P.1 variant of the SARS-CoV-2|efternamn2=Marquitti|förnamn6=Otavio|efternamn5=Silva|förnamn5=Rafael Lopes Paixão da|efternamn4=Borges|förnamn4=Marcelo Eduardo|efternamn3=Ferreira|förnamn3=Leonardo Souto|förnamn2=Flavia Maria Darcie|url=https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.03.03.21252706v1|efternamn=Coutinho|förnamn=Renato Mendes|språk=en|doi=10.1101/2021.03.03.21252706|sid=2021.03.03.21252706|hämtdatum=2021-03-21|år=2021-03-05|tidskrift=medRxiv|efternamn6=Canton}}</ref>
| style="background:#ffaaaa" |≈161% {{Abbr|(145–176%)|95% säkerhetsintervall}} mer smittsam<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Model-based evaluation of transmissibility and reinfection for the P.1 variant of the SARS-CoV-2|efternamn2=Marquitti|förnamn6=Otavio|efternamn5=Silva|förnamn5=Rafael Lopes Paixão da|efternamn4=Borges|förnamn4=Marcelo Eduardo|efternamn3=Ferreira|förnamn3=Leonardo Souto|förnamn2=Flavia Maria Darcie|url=https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.03.03.21252706v1|efternamn=Coutinho|förnamn=Renato Mendes|språk=en|doi=10.1101/2021.03.03.21252706|sid=2021.03.03.21252706|hämtdatum=2021-03-21|år=2021-03-05|tidskrift=medRxiv|efternamn6=Canton}}</ref>
| style="background:#FFFF00" |≈45% mer dödlig.<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil|förnamn2=Thomas A.|förnamn6=Swapnil|efternamn5=Candido|förnamn5=Darlan da S.|efternamn4=Claro|förnamn4=Ingra M.|efternamn3=Whittaker|förnamn3=Charles|efternamn2=Mellan|efternamn=Faria|url=https://science.sciencemag.org/content/early/2021/04/13/science.abh2644|förnamn=Nuno R.|språk=en|pmid=33853970|doi=10.1126/science.abh2644|issn=0036-8075|hämtdatum=2021-04-18|år=2021-04-14|tidskrift=Science|efternamn6=Mishra}}</ref>
| style="background:#FFFF00" |≈80% {{Abbr|(40–120%)|95% säkerhetsintervall}} mer dödlig.<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil|förnamn2=Thomas A.|förnamn6=Swapnil|efternamn5=Candido|förnamn5=Darlan da S.|efternamn4=Claro|förnamn4=Ingra M.|efternamn3=Whittaker|förnamn3=Charles|efternamn2=Mellan|efternamn=Faria|url=https://science.sciencemag.org/content/early/2021/04/13/science.abh2644|förnamn=Nuno R.|språk=en|pmid=33853970|doi=10.1126/science.abh2644|issn=0036-8075|hämtdatum=2021-04-18|år=2021-04-14|tidskrift=Science|efternamn6=Mishra}}</ref>
| style="background:#ffcc88" |Tydlig minskning av effektiv neutralisering av antikroppar<ref>{{Webbref|titel=Risk Assessment: Risk related to the spread of new SARS-CoV-2 variants of concern in the EU/EEA – first update|url=https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/covid-19-risk-assessment-spread-new-variants-concern-eueea-first-update|verk=European Centre for Disease Prevention and Control|datum=2021-01-21|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref>
| style="background:#ffcc88" |Tydlig minskning av effektiv neutralisering ([[ECDC]])
| style="background:#ffcc88" |Global spridning
|-
|-
|{{Flaggbild|Storbritannien}} [[Storbritannien]]
|{{Flaggbild|Storbritannien}} [[Storbritannien]]
{{Flaggbild|Nigeria}} [[Nigeria]]
{{Flaggbild|Nigeria}} [[Nigeria]]
|december 2020<ref>{{Tidningsref|rubrik=Another new coronavirus variant seen in the UK|url=https://www.bbc.com/news/health-56082573|tidning=BBC News|datum=2021-02-16|hämtdatum=2021-05-17|språk=en-GB}}</ref>
|december 2020
⚫
| style="background:#ffcc88" |Global spridning
|B.1.525<ref name=":3">{{Webbref|titel=Lineage B.1.525|url=https://cov-lineages.org/global_report_B.1.525.html|verk=cov-lineages.org|hämtdatum=2021-03-21}}</ref>
|B.1.525<ref name=":3">{{Webbref|titel=Lineage B.1.525|url=https://cov-lineages.org/global_report_B.1.525.html|verk=cov-lineages.org|hämtdatum=2021-03-21}}</ref>
|20C
|20C
Rad 123: Rad 124:
| style="background:#eeeeee" |Under utredning
| style="background:#eeeeee" |Under utredning
| style="background:#eeeeee" |Under utredning
| style="background:#eeeeee" |Under utredning
| style="background:#FFFF00" |Potentiell minskad neutralisering av antikroppar<ref>{{Webbref|titel=Cases, Data, and Surveillance|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/variant-surveillance/variant-info.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-05-17|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref>
| style="background:#FFFF00" |Måttligt minskad neutralisering
|-
([[COG-UK]])
|{{Flaggbild|Storbritannien}} [[Storbritannien]]
| style="background:#ffcc88" |Global spridning
{{Flaggbild|USA}} [[USA]]
|februari 2021<ref name=":6">{{Webbref|titel=Variants: distribution of cases data|url=https://www.gov.uk/government/publications/covid-19-variants-genomically-confirmed-case-numbers/variants-distribution-of-cases-data|verk=GOV.UK|hämtdatum=2021-05-17|språk=en}}</ref>
⚫
| style="background:#FFFF00" |Internationell spridning
|[[Variant B.1.1.7#E484K mutation|B.1.1.7 med E484K]]
|20I/501Y.V1/S:E484K
|VOC-21FEB-02<ref name=":6" />
|B.1.1.7+E484K<ref>{{Tidskriftsref|rubrik=Comparative Analysis of Emerging B.1.1.7+E484K SARS-CoV-2 isolates from Pennsylvania|efternamn2=Bianco|förnamn6=John|efternamn5=Neide|förnamn5=Brandy|efternamn4=Ahmed|förnamn4=Azad|efternamn3=Denu|förnamn3=Lidiya|förnamn2=Colleen|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8077577/|efternamn=Moustafa|förnamn=Ahmed M.|pmid=33907751|pmc=8077577|doi=10.1101/2021.04.21.440801|hämtdatum=2021-05-17|år=2021-04-21|tidskrift=bioRxiv|efternamn6=Everett}}</ref>
|N501Y, 69–70del, P681H,<ref>{{Webbref|titel=Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/science/science-briefs/scientific-brief-emerging-variants.html|verk=Centers for Disease Control and Prevention|datum=2020-02-11|hämtdatum=2021-05-17|språk=en-us|efternamn=CDC}}</ref><ref>{{Webbref|url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/959438/Technical_Briefing_VOC_SH_NJL2_SH2.pdf|titel=Investigation of novel SARS-COV-2 variant - Variant of Concern 202012/01|hämtdatum=17 maj 2021|datum=21 december 2020|utgivare=PHE|författare=Chand et al.}}</ref> E484K
|Under utredning
|Under utredning
|Under utredning
|}
|}


{{anmärkningslista}}


== Särskilda varianter ==
== Särskilda varianter ==

Versionen från 17 maj 2021 kl. 19.42

Coronavirus

sars-cov-2
Denna artikel är en del av
serien om coronavirus:
Olika coronavirus
HCoV-229E · HCoV-NL63 · IBV · MERS-CoV (orsakar mers) · SARS-CoV (orsakar sars) · Sars-cov-2 (varianter)
Covid-19
Pandemin (Europa · Finland · Danmark · Norge · Sverige) – Covid-19 och graviditet · Provtagning · Sjukdomen · Viruset · Postcovid
Egenskaper
Droppsmitta · Fladdermusburna virus · Lunginflammation · Pandemi · Samhällsfarlig sjukdom · Zoonos
Motåtgärder
Covid-19-vaccin · Flockimmunitet · Karantän · Munskydd · Nedstängning · Smittskydd · Social distansering
Sverige
Folkhälsomyndigheten · Krisinformation.se · MSB · Statsepidemiolog (Anders Tegnell) · Coronakommissionen
Internationellt
EMA · WHO (internationellt hälsonödläge)

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), viruset som orsakar Covid-19, has många olika varianter; vissa är eller tros varit av särskild betydelse. Denna artikeln diskuterar varianter av SARS-CoV-2 som har särskild betydelse.

Sekvensen WIV04/2019, som tillhör GISAID S kladen / PANGOLIN A kladen / Nextstrain 19B kladen, som tros vara den originella sekvensen som smittar människor, känd som "sekvens noll" (sequence zero).[1] Sekvensen WIV04/2019 sekvenserades från en symptomatisk patient den 30 december 2019 och är en referenssekvens.[2] Dock refererar en annan grupp (Sudhir Kumar m.fl.),[3] till NCBI referensgenomet (GenBankID:NC_045512; GISAID ID: EPI_ISL_402125),[4] denna sekvens samlades in den 26 december 2019,[5] dock använde denna gruppen också WIV04 GISAID referensgenomet med (ID: EPI_ISL_402124)[6] i sin analys.[7] Den äldsta sekvensen, Wuhan-1, samlades in den 24 december 2019.[3]

Sammanfattning

Upptäcktes Spridning Identifikation Särskilda mutationer Bevis på kliniska förändringar
Land Datum PANGOLIN variant[8] Nextstrain[9] klad[10] PHE Variant[11] Andra namn Smittsamhet Virulens Vaccinimmunogenitet
Storbritannien Storbritannien februari 2020[8] Global spridning B.1.1.7 20B/501Y.V1 VOC-202012/01[12] ― N501Y, 69–70del, P681H[12][13] ≈74% mer smittsam[14] ≈61% (42–82%) mer dödlig[15] Ingen förändring[16]

(ECDC)

Nigeria Nigeria augusti 2020[17] Global spridning B.1.1.207 ― ―
―
 P681H[18] Inget bevis på förändring Inget bevis på förändring Under utredning
USA USA juni 2020[19] Global spridning B.1.429, B.1.427[19] 20C/S:452R ― CAL.20C[20] I4205V, D1183Y, S13I, W152C, L452R ≈20% (18,6–24,2%) mer smittsam[21] Under utredning Måttligt minskad känslighet för neutraliserande antikroppar[22]
Danmark Danmark september 2020[23] Tros vara utrotad
―[a]
 Kluster 5, ΔFVI-spike (SSI)[24] Y453F, 69–70deltaHV[24] ― Måttligt minskad känslighet för neutraliserande antikroppar[25]
Sydafrika Sydafrika oktober 2020[26] Global spridning B.1.351[27] 20H/501Y.V2[28] VOC-202012/02 501Y.V2[29] N501Y, K417N, E484K[12] ≈50% (20–113%) mer smittsam[30] Inget bevis på förändring Signifikant reduktion i neutralisering av antikroppar[31][32]
Indien Indien oktober 2020[33] Global spridning B.1.617 ― VUI-21APR-01[34] E484Q, L452R, P681R[35] Potentiellt ≈120% högre smittsamhet Under utredning Potentiell minskad neutralisering av antikroppar[36]
Japan Japan

Brasilien Brasilien

december 2020[37] Global spridning P.1[30] 20J/501Y.V3[38] VOC-202101/02 B.1.1.28.1[39][40] N501Y, E484K[12] ≈161% (145–176%) mer smittsam[41] ≈80% (40–120%) mer dödlig.[42] Tydlig minskning av effektiv neutralisering av antikroppar[43]
Storbritannien Storbritannien

Nigeria Nigeria

december 2020[44] Global spridning B.1.525[45] 20C VUI-202102/03[46] ― E484K, F888L[45] Under utredning Under utredning Potentiell minskad neutralisering av antikroppar[47]
Storbritannien Storbritannien

USA USA

februari 2021[48] Internationell spridning B.1.1.7 med E484K 20I/501Y.V1/S:E484K VOC-21FEB-02[48] B.1.1.7+E484K[49] N501Y, 69–70del, P681H,[50][51] E484K Under utredning Under utredning Under utredning
  1. ^ "—" betyder att det inte finns någon pålitlig källa att citera.

Särskilda varianter

Variant B.1.1.207

Varianten sekvenserades först i Nigeria, [52] denna varianten har en P681H mutation, vilket även återfinns i Storbritanniens VOC-202012/01. Den delar inga andra mutationer med VOC-202012/01 och sedan slutet av december 2020 står denna varianten för ungefär 1% av alla sekvenserade fall i Nigeria.[53]

Variant B.1.1.7 / Variant of Concern 202012/01

Huvudartikel: Variant B.1.1.7

Varianten upptäckes i oktober 2020 i Storbritannien i ett testprov taget månaden tidigare,[54] tidigare nämnd som Variant Under Investigation in December 2020 (VUI – 202012/01)[55] och som lineage B.1.1.7 eller 20I/501Y.V1 (tidigare 20B/501Y.V1).[56] Den korrelerar med den betydliga ökningen av bekräftade fall av Covid-19 i Storbritannien och associeras dels med N501Y-mutationen. Det finns vissa belägg som visar att denna varianten har en smittsamhet som är mellan 30–70% högre än andra mutationer och tidigare studier visar också en ökning i dödlighet.[57]

Kluster 5

Huvudartikel: Kluster 5

I början av november 2019 upptäcktes Kluster 5, också kallad ΔFVI-spike av danska Statens Serum Institut (SSI), i Nørrejylland i Danmark. Mutationen tros ha spridits från minkar till människor genom minkfarmar. Den 4 november meddelade den danska regeringen att alla minkar i landet skulle avlivas och grävas ner för att förebygga en spridning av denna mutationen och ytterligare mutationer. En nedstängning av flera kommuner infördes i Nørrejylland och den 5 november hade det upptäckts runt 214 mink-relaterade smittofall bland människor.[58]

SSI varnade att mutationen kunde minska effekten av Covid-19 vaccin som var under utveckling men var inte trolig att göra de värdelösa. Den 19 november 2020 meddelade SSI att kluster 5 med största sannolikhet dött ut.[59]

Variant 501.V2

Huvudartikel: Variant 501.V2

Den 18 december 2020 upptäcktes variant 501.V2, även kallad 501.V2, 20H/501Y.V2 (tidigare 20C/501Y.V2), eller lineage B.1.351,[60] i Sydafrika.[61] Forskare och tjänstemän rapporterade att varianten spreds i större utsträckning bland yngre utan några bakomliggande sjukdomar och till skillnad från andra varianter leder denna varianten till mer allvarliga sjukdomsförlopp i större omfattning.[62] Varianten korrelerar också med den betydliga ökningen av bekräftade fall av Covid-19 i Sydafrika.[63]

Variant P.1

Huvudartikel: Variant P.1

Variant P.1 (Lineage P1), upptäcktes i Tokyo den 6 januari 2021. Den upptäcktes först hos fyra personer som anlände i Tokyo efter att ha rest från Amazonas i Brasilien den 2 januari 2021.[64] Den 12 januari 2021 rapporterade Brasiliens folkhälsomyndighet 13 bekräftade fall av varianten i Manaus.[65] Varianten fanns inte i sekvenserade prover från mars till november 2020 men identifierades i 42% av sekvenserade prover från december 2020.[66]

Det har även identifierats en annan variant i Rio de Janeiro, Brasilien, som nu döpts till Variant P.2,[67] som har mutationen E484K. Variant P.2 är inte direkt relaterad till variant P.1 men båda har mutationen E484K.[68]

Variant B.1.429 / CAL.20C

CAL.20C[69] identifierades först av forskare i juli 2020 i ett prov av 1 230 prover som samlades in i Los Angeles County. Denna varianten som döpts till variant B.1.429, har mutationen L452R och upptäcktes inte igen innan oktober 2020. I november 2020 stod CAL.20C för 36% av alla sekvenserade prover och i januari 2021 stod varianten för ungefär 50% av alla sekvenserade prover.[70] Varianten har också upptäckts i andra delar av norra Kalifornien. Mellan november och december 2020 ökade varianten från 3% till 25% i alla sekvenserade prover.[71]

Variant B.1.617

Variant B.1.617, kallas även i folkmun "indiska dubbelmutationen",[72] är en mutation som först upptäcktes i Indien runt oktober 2020. I januari 2021 var det endast ett fåtal bekräftade fall av mutationen och fram till april hade mutationen spridits till 20 länder i alla kontinenter förutom antarktis och sydamerika.[73][74][75] Varianten har 15 olika definierade mutationer varav några av spikproteins-mutationerna P681R, E484Q[76] och L452R,[77] de sista två förenklar virusets möjlighet att undvika antikroppar vilket kan göra vaccin ineffektiva.[78]

Den 15 april meddelade Public Health England (PHE) att varianten kom till att bli "Variant under Investigation", VUI-21APR-01.[79]

Särskilda mutationer

D614G

D614G-mutationen förändrade coronavirusets spike-protein, eller ”taggar”, och gjorde att viruset kunde öka sin spridning. Idag är det den vanligaste formen av coronaviruset i Europa.

E484K

Mutationen E484K ser ut att undvika några av de antikroppar i coronavirusets spike-protein, eller ”taggar”, som ett vaccin eller tidigare sjukdom bildar. Därmed kan varianten minska vaccinernas effektivitet

N501Y

N501Y har några genetiska skillnader i det så kallade spikeproteinet, denna mutation och andra visar att spikproteinet kan förändras utan att förstöra virusets förmåga att spridas vidare. Mutationen påverkar liganden på grund av dess position inuti lipidhöljets proteiners receptor-bindande domän som behövs för att bindas till ACE2 hos människans celler. Denna mutationen återfinns hos Variant P.1 i Brasilien/Japan,[80] Variant of Concern 202012/01 i Storbritannien, Variant 501.V2 i Sydfarika och COH.20G/501Y i Columbus, Ohio.[81]

N439K

Mutationen upptäcktes för första gången under våren 2020 i Skottland där den tros ha sitt ursprung.[82] Forskare tror att denna mutationen kan vara mer smittsam än den variant som först upptäcktes i Wuhan, Kina.[83] Forskare tror även att denna variant kan leda till att de vaccin som tagits fram kan ha en försämrad effekt.[84][85][86][87] Denna mutation och andra visar att spikproteinet kan förändras utan att förstöra virusets förmåga att spridas vidare. Forskare har också sedan tidigare visat att denna mutation är åtminstone immun mot en slags antikropp som smittade människor kan producera.[88]

Referenser

  1. ^ Zhukova, Anna; Blassel, Luc; Lemoine, Frédéric; Morel, Marie; Voznica, Jakub; Gascuel, Olivier (0). ”Origin, evolution and global spread of SARS-CoV-2”. Comptes Rendus. Biologies 0 (0): sid. 1–19. doi:10.5802/crbiol.29. https://comptes-rendus.academie-sciences.fr/biologies/item/CRBIOL_0__0_0_A1_0/. Läst 31 januari 2021. 
  2. ^ Zhukova, Anna; Blassel, Luc; Lemoine, Frédéric; Morel, Marie; Voznica, Jakub; Gascuel, Olivier (0). ”Origin, evolution and global spread of SARS-CoV-2”. Comptes Rendus. Biologies 0 (0): sid. 1–19. doi:10.5802/crbiol.29. https://comptes-rendus.academie-sciences.fr/biologies/item/CRBIOL_0__0_0_A1_0/. Läst 17 maj 2021. 
  3. ^ [a b] Sudhir Kumar et al. (4 maj 2021). ”An evolutionary portrait of the progenitor SARS-CoV-2 and its dominant offshoots in COVID-19 pandemic”. Molecular Biology and Evolution. https://academic.oup.com/mbe/advance-article/doi/10.1093/molbev/msab118/6257226. Läst 17 maj 2021. 
  4. ^ Fan Wu, Su Zhao, Bin Yu, Yan-Mei Chen, Wen Wang, Zhi-Gang Song, Yi Hu, Zhao-Wu Tao, Jun-Hua Tian, Yuan-Yuan Pei, Ming-Li Yuan, Yu-Ling Zhang, Fa-Hui Dai, Yi Liu, Qi-Min Wang, Jiao-Jiao Zheng, Lin Xu, Edward C Holmes, Yong-Zhen Zhang (3 februari 2020). ”A new coronavirus associated with human respiratory disease in China”. NIH, National Library of Medicine. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32015508/. Läst 17 maj 2021. 
  5. ^ Matteo Chiara, David S Horner, Carmela Gissi, Graziano Pesole (19 februari 2021). ”Comparative genomics reveals early emergence and biased spatio-temporal distribution of SARS-CoV-2”. NIH, National Library of Medicine. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33605421/. Läst 17 maj 2021. 
  6. ^ Zhengli, Shi et al. (3 februari 2020). ”A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin”. Nature, PMC. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7095418. Läst 17 maj 2021. 
  7. ^ Okada Pilailuk, Buathong Rome, Phuygun Siripaporn, Thanadachakul Thanutsapa, Parnmen Sittiporn, Wongboot Warawan, Waicharoen Sunthareeya, Wacharapluesadee Supaporn, Uttayamakul Sumonmal, Vachiraphan Apichart, Chittaganpitch Malinee, Mekha Nanthawan, Janejai Noppavan, Iamsirithaworn Sopon, Lee Raphael TC, Maurer-Stroh Sebastian. (februari 2020). ”Early transmission patterns of coronavirus disease 2019 (COVID-19) in travellers from Wuhan to Thailand, January 2020”. Euro Surveill. https://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.8.2000097. Läst 17 maj 2021. 
  8. ^ [a b] ”PANGO lineages”. cov-lineages.org. https://cov-lineages.org/lineages.html. Läst 21 mars 2021. 
  9. ^ Hadfield, James; Megill, Colin; Bell, Sidney M; Huddleston, John; Potter, Barney; Callender, Charlton (2018-12-01). ”Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution”. Bioinformatics 34 (23): sid. 4121–4123. doi:10.1093/bioinformatics/bty407. ISSN 1367-4803. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty407. Läst 21 mars 2021. 
  10. ^ ”Nextstrain” (på engelska). nextstrain.org. https://nextstrain.org/. Läst 21 mars 2021. 
  11. ^ ”Variants: distribution of cases data” (på engelska). GOV.UK. https://www.gov.uk/government/publications/covid-19-variants-genomically-confirmed-case-numbers/variants-distribution-of-cases-data. Läst 21 mars 2021. 
  12. ^ [a b c d] CDC (11 februari 2020). ”Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)” (på amerikansk engelska). Centers for Disease Control and Prevention. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html. Läst 21 mars 2021. 
  13. ^ [https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/959438/Technical_Briefing_VOC_SH_NJL2_SH2.pdf ”Investigation of novel SARS-COV-2 variant Variant of Concern 202012/01”]. Public Health England. sid. 6. https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/959438/Technical_Briefing_VOC_SH_NJL2_SH2.pdf. Läst 21 mars 2021. 
  14. ^ [https://www.imperial.ac.uk/media/imperial-college/medicine/mrc-gida/2020-12-31-COVID19-Report-42-Preprint-VOC.pdf ”Transmission of SARS-CoV-2 Lineage B.1.1.7 in England: Insights from linking epidemiological and genetic data”]. Imperial UK. https://www.imperial.ac.uk/media/imperial-college/medicine/mrc-gida/2020-12-31-COVID19-Report-42-Preprint-VOC.pdf. Läst 21 mars 2021. 
  15. ^ Challen, Robert; Brooks-Pollock, Ellen; Read, Jonathan M.; Dyson, Louise; Tsaneva-Atanasova, Krasimira; Danon, Leon (2021-03-10). ”Risk of mortality in patients infected with SARS-CoV-2 variant of concern 202012/1: matched cohort study” (på engelska). BMJ 372: sid. n579. doi:10.1136/bmj.n579. ISSN 1756-1833. PMID 33687922. https://www.bmj.com/content/372/bmj.n579. Läst 21 mars 2021. 
  16. ^ ”Risk Assessment: Risk related to the spread of new SARS-CoV-2 variants of concern in the EU/EEA – first update” (på engelska). European Centre for Disease Prevention and Control. 21 januari 2021. https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/covid-19-risk-assessment-spread-new-variants-concern-eueea-first-update. Läst 18 april 2021. 
  17. ^ ”PANGO lineages”. cov-lineages.org. https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.1.207.html. Läst 17 maj 2021. 
  18. ^ CDC (11 februari 2020). ”Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)” (på amerikansk engelska). Centers for Disease Control and Prevention. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html. Läst 31 januari 2021. 
  19. ^ [a b] ”PANGO lineages”. cov-lineages.org. https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.429.html. Läst 21 mars 2021. 
  20. ^ ”Southern California COVID-19 Strain Expands Global Reach” (på amerikansk engelska). Southern California COVID-19 Strain Expands Global Reach. https://www.cedars-sinai.org/newsroom/southern-california-covid-19-strain-rapidly-expands-global-reach/. Läst 18 april 2021. 
  21. ^ CDC (11 februari 2020). ”Cases, Data, and Surveillance” (på amerikansk engelska). Centers for Disease Control and Prevention. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/variant-surveillance/variant-info.html. Läst 21 mars 2021. 
  22. ^ WadmanFeb. 23, Meredith; 2021; Pm, 1:20 (23 februari 2021). ”California coronavirus strain may be more infectious—and lethal” (på engelska). Science | AAAS. https://www.sciencemag.org/news/2021/02/coronavirus-strain-first-identified-california-may-be-more-infectious-and-cause-more. Läst 17 maj 2021. 
  23. ^ ”WHO | SARS-CoV-2 mink-associated variant strain – Denmark”. WHO. http://www.who.int/csr/don/06-november-2020-mink-associated-sars-cov2-denmark/en/. Läst 17 maj 2021. 
  24. ^ [a b] ”Working paper on SARS-CoV-2 spike mutations arising in Danish mink, their 2 spread to humans and neutralization data.”. SSI. 11 november 2020. https://files.ssi.dk/Mink-cluster-5-short-report_AFO2. Läst 31 januari 2021. 
  25. ^ ”WHO | SARS-CoV-2 mink-associated variant strain – Denmark”. WHO. http://www.who.int/csr/don/06-november-2020-mink-associated-sars-cov2-denmark/en/. Läst 17 maj 2021. 
  26. ^ CDC (11 februari 2020). ”Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)” (på amerikansk engelska). Centers for Disease Control and Prevention. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/science/science-briefs/scientific-brief-emerging-variants.html. Läst 17 maj 2021. 
  27. ^ CDC (11 februari 2020). ”Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)” (på amerikansk engelska). Centers for Disease Control and Prevention. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html. Läst 21 mars 2021. 
  28. ^ CDC (11 februari 2020). ”Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)” (på amerikansk engelska). Centers for Disease Control and Prevention. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html. Läst 21 mars 2021. 
  29. ^ ”Risk Assessment: Risk related to the spread of new SARS-CoV-2 variants of concern in the EU/EEA – first update” (på engelska). European Centre for Disease Prevention and Control. 21 januari 2021. https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/covid-19-risk-assessment-spread-new-variants-concern-eueea-first-update. Läst 17 maj 2021. 
  30. ^ [a b] [https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/COVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEA-first-update.pdf ”Risk related to the spread of new SARS-CoV-2 variants of concern in the EU/EEA – first update”]. ECDC. 21 januari 2021. https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/COVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEA-first-update.pdf. Läst 21 mars 2021. 
  31. ^ Planas, Delphine; Bruel, Timothée; Grzelak, Ludivine; Guivel-Benhassine, Florence; Staropoli, Isabelle; Porrot, Françoise (2021-05). ”Sensitivity of infectious SARS-CoV-2 B.1.1.7 and B.1.351 variants to neutralizing antibodies” (på engelska). Nature Medicine 27 (5): sid. 917–924. doi:10.1038/s41591-021-01318-5. ISSN 1546-170X. https://www.nature.com/articles/s41591-021-01318-5. Läst 17 maj 2021. 
  32. ^ ”Sinovac Covid-19 vaccine offers less protection against South African strain” (på engelska). South China Morning Post. 20 april 2021. https://www.scmp.com/news/hong-kong/health-environment/article/3130355/coronavirus-sinovac-vaccine-gives-70-cent-less. Läst 17 maj 2021. 
  33. ^ ”PANGO lineages”. cov-lineages.org. https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.617.html. Läst 17 maj 2021. 
  34. ^ ”Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK” (på engelska). GOV.UK. https://www.gov.uk/government/news/confirmed-cases-of-covid-19-variants-identified-in-uk. Läst 18 april 2021. 
  35. ^ Nuki, Paul; Newey, Sarah (16 april 2021). ”Arrival of India’s ‘double mutation’ adds to variant woes, but threat posed remains unclear” (på brittisk engelska). The Telegraph. ISSN 0307-1235. https://www.telegraph.co.uk/global-health/science-and-disease/arrival-indias-double-mutation-adds-variant-woes-threat-posed/. Läst 18 april 2021. 
  36. ^ Yadav, Pragya D.; Sapkal, Gajanan N.; Abraham, Priya; Ella, Raches; Deshpande, Gururaj; Patil, Deepak Y. (2021-04-23). ”Neutralization of variant under investigation B.1.617 with sera of BBV152 vaccinees” (på engelska). bioRxiv: sid. 2021.04.23.441101. doi:10.1101/2021.04.23.441101. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.04.23.441101v1. Läst 17 maj 2021. 
  37. ^ Kupferschmidt, Kai (2021-01-22). ”New mutations raise specter of ‘immune escape’” (på engelska). Science 371 (6527): sid. 329–330. doi:10.1126/science.371.6527.329. ISSN 0036-8075. PMID 33479129. https://science.sciencemag.org/content/371/6527/329. Läst 17 maj 2021. 
  38. ^ CDC (11 februari 2020). ”Cases, Data, and Surveillance” (på amerikansk engelska). Centers for Disease Control and Prevention. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/variant-surveillance/variant-info.html. Läst 21 mars 2021. 
  39. ^ ”Lineage P.1”. cov-lineages.org. https://cov-lineages.org/global_report_P.1.html. Läst 17 maj 2021. 
  40. ^ Innovation, Agency for Clinical (13 maj 2021). ”Living Evidence - SARS-CoV-2 variants” (på engelska). Agency for Clinical Innovation. https://aci.health.nsw.gov.au/covid-19/critical-intelligence-unit/sars-cov-2-variants. Läst 17 maj 2021. 
  41. ^ Coutinho, Renato Mendes; Marquitti, Flavia Maria Darcie; Ferreira, Leonardo Souto; Borges, Marcelo Eduardo; Silva, Rafael Lopes Paixão da; Canton, Otavio (2021-03-05). ”Model-based evaluation of transmissibility and reinfection for the P.1 variant of the SARS-CoV-2” (på engelska). medRxiv: sid. 2021.03.03.21252706. doi:10.1101/2021.03.03.21252706. https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.03.03.21252706v1. Läst 21 mars 2021. 
  42. ^ Faria, Nuno R.; Mellan, Thomas A.; Whittaker, Charles; Claro, Ingra M.; Candido, Darlan da S.; Mishra, Swapnil (2021-04-14). ”Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil” (på engelska). Science. doi:10.1126/science.abh2644. ISSN 0036-8075. PMID 33853970. https://science.sciencemag.org/content/early/2021/04/13/science.abh2644. Läst 18 april 2021. 
  43. ^ ”Risk Assessment: Risk related to the spread of new SARS-CoV-2 variants of concern in the EU/EEA – first update” (på engelska). European Centre for Disease Prevention and Control. 21 januari 2021. https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/covid-19-risk-assessment-spread-new-variants-concern-eueea-first-update. Läst 17 maj 2021. 
  44. ^ ”Another new coronavirus variant seen in the UK” (på brittisk engelska). BBC News. 16 februari 2021. https://www.bbc.com/news/health-56082573. Läst 17 maj 2021. 
  45. ^ [a b] ”Lineage B.1.525”. cov-lineages.org. https://cov-lineages.org/global_report_B.1.525.html. Läst 21 mars 2021. 
  46. ^ ”Variants: distribution of cases data” (på engelska). GOV.UK. https://www.gov.uk/government/publications/covid-19-variants-genomically-confirmed-case-numbers/variants-distribution-of-cases-data. Läst 21 mars 2021. 
  47. ^ CDC (11 februari 2020). ”Cases, Data, and Surveillance” (på amerikansk engelska). Centers for Disease Control and Prevention. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/variant-surveillance/variant-info.html. Läst 17 maj 2021. 
  48. ^ [a b] ”Variants: distribution of cases data” (på engelska). GOV.UK. https://www.gov.uk/government/publications/covid-19-variants-genomically-confirmed-case-numbers/variants-distribution-of-cases-data. Läst 17 maj 2021. 
  49. ^ Moustafa, Ahmed M.; Bianco, Colleen; Denu, Lidiya; Ahmed, Azad; Neide, Brandy; Everett, John (2021-04-21). ”Comparative Analysis of Emerging B.1.1.7+E484K SARS-CoV-2 isolates from Pennsylvania”. bioRxiv. doi:10.1101/2021.04.21.440801. PMID 33907751. PMC: 8077577. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8077577/. Läst 17 maj 2021. 
  50. ^ CDC (11 februari 2020). ”Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)” (på amerikansk engelska). Centers for Disease Control and Prevention. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/science/science-briefs/scientific-brief-emerging-variants.html. Läst 17 maj 2021. 
  51. ^ Chand et al. (21 december 2020). ”Investigation of novel SARS-COV-2 variant - Variant of Concern 202012/01”. PHE. https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/959438/Technical_Briefing_VOC_SH_NJL2_SH2.pdf. Läst 17 maj 2021. 
  52. ^ ”Detection of SARS-CoV-2 P681H Spike Protein Variant in Nigeria” (på engelska). Virological. 23 december 2020. https://virological.org/t/detection-of-sars-cov-2-p681h-spike-protein-variant-in-nigeria/567. Läst 31 januari 2021. 
  53. ^ ”Detection of SARS-CoV-2 P681H Spike Protein Variant in Nigeria” (på engelska). Virological. 23 december 2020. https://virological.org/t/detection-of-sars-cov-2-p681h-spike-protein-variant-in-nigeria/567. Läst 31 januari 2021. 
  54. ^ ”Covid: Nations impose UK travel bans over new variant” (på brittisk engelska). BBC News. 20 december 2020. https://www.bbc.com/news/world-europe-55385768. Läst 31 januari 2021. 
  55. ^ ”PHE investigating a novel variant of COVID-19” (på engelska). GOV.UK. https://www.gov.uk/government/news/phe-investigating-a-novel-variant-of-covid-19. Läst 31 januari 2021. 
  56. ^ CDC (11 februari 2020). ”Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)” (på amerikansk engelska). Centers for Disease Control and Prevention. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html. Läst 31 januari 2021. 
  57. ^ ”Coronavirus: UK variant 'may be more deadly'” (på brittisk engelska). BBC News. 22 januari 2021. https://www.bbc.com/news/health-55768627. Läst 31 januari 2021. 
  58. ^ ”Detection of new SARS-CoV-2 variants related to mink”. ECDC. 12 november 2020. https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/RRA-SARS-CoV-2-in-mink-12-nov-2020.pdf. Läst 31 januari 2021. 
  59. ^ ”De fleste restriktioner lempes i Nordjylland” (på danska). sum.dk. http://sum.dk/nyheder/2020/november/de-fleste-restriktioner-lempes-i-nordjylland. Läst 31 januari 2021. 
  60. ^ CDC (11 februari 2020). ”Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)” (på amerikansk engelska). Centers for Disease Control and Prevention. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html. Läst 31 januari 2021. 
  61. ^ Fink, Sheri (18 december 2020). ”South Africa announces a new coronavirus variant.” (på amerikansk engelska). The New York Times. ISSN 0362-4331. https://www.nytimes.com/2020/12/19/world/south-africa-announces-a-new-coronavirus-variant.html. Läst 31 januari 2021. 
  62. ^ ”Update On Covid-19 (18th December 2020) - SA Corona Virus Online Portal” (på en-ZA). SA Corona Virus Online Portal. https://sacoronavirus.co.za/2020/12/18/update-on-covid-19-18th-december-2020/. Läst 31 januari 2021. 
  63. ^ Fink, Sheri (18 december 2020). ”South Africa announces a new coronavirus variant.” (på amerikansk engelska). The New York Times. ISSN 0362-4331. https://www.nytimes.com/2020/12/19/world/south-africa-announces-a-new-coronavirus-variant.html. Läst 31 januari 2021. 
  64. ^ ”Japan finds new coronavirus variant in travelers from Brazil” (på engelska). Japan Today. https://japantoday.com/category/national/corrected-update-3-japan-finds-new-coronavirus-variant-in-travellers-from-brazil. Läst 31 januari 2021. 
  65. ^ ”Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings” (på engelska). Virological. 12 januari 2021. https://virological.org/t/genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings/586. Läst 31 januari 2021. 
  66. ^ ”Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings” (på engelska). Virological. 12 januari 2021. https://virological.org/t/genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings/586. Läst 31 januari 2021. 
  67. ^ ”PANGO lineages”. cov-lineages.org. https://cov-lineages.org/lineages/lineage_P.2.html. Läst 31 januari 2021. 
  68. ^ Voloch, Carolina M.; F, Ronaldo da Silva; Almeida, Luiz G. P. de; Cardoso, Cynthia C.; Brustolini, Otavio J.; Gerber, Alexandra L. (2020-12-26). ”Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil” (på engelska). medRxiv: sid. 2020.12.23.20248598. doi:10.1101/2020.12.23.20248598. ISSN 2024-8598. https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.12.23.20248598v1. Läst 31 januari 2021. 
  69. ^ ”Local COVID-19 Strain Found in Over One-Third of Los Angeles Patients” (på amerikansk engelska). Local COVID-19 Strain Found in Over One-Third of Los Angeles Patients. Arkiverad från originalet den 31 januari 2021. https://web.archive.org/web/20210131072526/https://www.cedars-sinai.org/newsroom/local-covid-19-strain-found-in-over-one-third-of-los-angeles-patients/. Läst 31 januari 2021. 
  70. ^ Zimmer, Carl (19 januari 2021). ”New California Variant May Be Driving Virus Surge There, Study Suggests” (på amerikansk engelska). The New York Times. ISSN 0362-4331. https://www.nytimes.com/2021/01/19/health/coronavirus-variant-california.html. Läst 31 januari 2021. 
  71. ^ Weise, Karen Weintraub and Elizabeth. ”New strains of COVID swiftly moving through the US need careful watch, scientists say” (på amerikansk engelska). USA TODAY. https://www.usatoday.com/story/news/health/2021/01/22/covid-new-virus-mutations-but-vaccines-fight-outbreak/4216815001/. Läst 31 januari 2021. 
  72. ^ ”Dubbelmutationen har kommit till Europa: Extra orolig”. Aftonbladet. https://www.aftonbladet.se/a/aPn4lM. Läst 18 april 2021. 
  73. ^ ”PANGO lineages”. cov-lineages.org. https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.617.html. Läst 18 april 2021. 
  74. ^ Koshy, Jacob (8 april 2021). ”Coronavirus | Indian ‘double mutant’ strain named B.1.617” (på Indian English). The Hindu. ISSN 0971-751X. https://www.thehindu.com/news/national/indian-double-mutant-strain-named-b1617/article34274663.ece. Läst 18 april 2021. 
  75. ^ ”India's variant-fuelled second wave coincided with spike in infected flights landing in Canada” (på kanadensisk engelska). torontosun. https://torontosun.com/news/local-news/indias-variant-fuelled-second-wave-coincided-with-spike-in-infected-flights-landing-in-canada. Läst 18 april 2021. 
  76. ^ Shrutirupa (17 april 2021). ”IS THIS COVID – 20? | Double Mutant Strain Explained” (på amerikansk engelska). Self Immune. https://selfimmune.com/2021/04/17/double-mutant-strain-explained/. Läst 18 april 2021. 
  77. ^ ”'Double mutant': What are the risks of India's new Covid-19 variant” (på brittisk engelska). BBC News. 25 mars 2021. https://www.bbc.com/news/world-asia-india-56517495. Läst 18 april 2021. 
  78. ^ Haseltine, William A.. ”An Indian SARS-CoV-2 Variant Lands In California. More Danger Ahead?” (på engelska). Forbes. https://www.forbes.com/sites/williamhaseltine/2021/04/12/an-indian-sars-cov-2-variant-lands-in-california-more-danger-ahead/. Läst 18 april 2021. 
  79. ^ ”Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK” (på engelska). GOV.UK. https://www.gov.uk/government/news/confirmed-cases-of-covid-19-variants-identified-in-uk. Läst 18 april 2021. 
  80. ^ ”Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings” (på engelska). Virological. 12 januari 2021. https://virological.org/t/genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings/586. Läst 31 januari 2021. 
  81. ^ ”Researchers Discover New Variant of COVID-19 Virus in Columbus, Ohio” (på engelska). wexnermedical.osu.edu. https://wexnermedical.osu.edu/mediaroom/pressreleaselisting/new-sars-cov2-variant. Läst 31 januari 2021. 
  82. ^ ”Hunt on for future Covid mutations that cause treatments to lose potency” (på engelska). the Guardian. 20 oktober 2020. http://www.theguardian.com/world/2020/oct/20/scientists-on-lookout-for-covid-mutations-which-cause-treatments-to-lose-potency. Läst 23 december 2020. 
  83. ^ ”N439K mutation of SARS-CoV-2 may be more infectious and antibody resistant than Wuhan strain” (på engelska). News-Medical.net. 27 november 2020. https://www.news-medical.net/news/20201127/N439K-mutation-of-SARS-CoV-2-may-be-more-infectious-and-antibody-resistant-than-Wuhan-strain.aspx. Läst 23 december 2020. 
  84. ^ ”N439K mutation of SARS-CoV-2 may be more infectious and antibody resistant than Wuhan strain” (på engelska). News-Medical.net. 27 november 2020. https://www.news-medical.net/news/20201127/N439K-mutation-of-SARS-CoV-2-may-be-more-infectious-and-antibody-resistant-than-Wuhan-strain.aspx. Läst 23 december 2020. 
  85. ^ TT (22 december 2020). ”Ny virusmutation oroar i Danmark”. SVT Nyheter. https://www.svt.se/nyheter/lokalt/skane/ny-virusmutation-oroar-i-danmark. Läst 23 december 2020. 
  86. ^ ”Coronavirus strain that can be less susceptible to vaccine found in Denmark — agency”. TASS. https://tass.com/world/1238695. Läst 23 december 2020. 
  87. ^ Weisblum, Yiska; Schmidt, Fabian; Zhang, Fengwen; DaSilva, Justin; Poston, Daniel; Lorenzi, Julio C. C. (2020-07-22). ”Escape from neutralizing antibodies by SARS-CoV-2 spike protein variants” (på engelska). bioRxiv: sid. 2020.07.21.214759. doi:10.1101/2020.07.21.214759. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.07.21.214759v1. Läst 23 december 2020. 
  88. ^ Li, Qianqian; Wu, Jiajing; Nie, Jianhui; Zhang, Li; Hao, Huan; Liu, Shuo (2020-09-03). ”The Impact of Mutations in SARS-CoV-2 Spike on Viral Infectivity and Antigenicity” (på english). Cell 182 (5): sid. 1284–1294.e9. doi:10.1016/j.cell.2020.07.012. ISSN 0092-8674. PMID 32730807. https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(20)30877-1. Läst 23 december 2020. 

Externa länkar

v • r
Covid-19
Sjukdomen och viruset
Covid-19-pandemin · Miljöeffekter
Covid-19-pandemin i världen  · Europa  · Sverige  · Norge  · Finland
Smitta, sjukdom, följder
Smittskydd och åtgärder
Epidemiologi
Sverige
Hämtad från ”https://sv.wikipedia.org/w/index.php?title=Varianter_av_sars-cov-2&oldid=49251902”